结论：在拒不支付劳动报酬罪的案件中，检察院起诉后，法院是否可以免除刑事处罚，需根据具体案情和法律规定综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、免除刑事处罚的法律依据
根据《中华人民共和国刑法》第三十七条：“对于犯罪情节轻微不需要判处刑罚的，可以免予刑事处罚，但是可以根据案件的不同情况，予以训诫或者责令具结悔过、赔礼道歉、赔偿损失，或者由主管部门予以行政处罚或者行政处分。”这一条款为法院在特定情况下免除刑事处罚提供了法律依据。
二、拒不支付劳动报酬罪免除刑事处罚的具体情形
犯罪情节轻微：
- 如果犯罪嫌疑人拒不支付劳动报酬的数额较小，且未造成严重后果，如未引发群体性事件、未严重影响社会秩序等，法院可能认为其犯罪情节轻微，从而考虑免除刑事处罚。
- 犯罪嫌疑人是否具有悔罪表现，如是否主动支付劳动报酬、是否积极配合调查等，也是法院判断犯罪情节是否轻微的重要因素。
自首或立功表现：
- 根据《中华人民共和国刑法》第六十七条和第六十八条，犯罪嫌疑人如果具有自首或立功表现，可以从轻或者减轻处罚。在特定情况下，这甚至可能成为法院免除刑事处罚的依据。
积极赔偿并取得谅解：
- 如果犯罪嫌疑人能够积极支付拖欠的劳动报酬，并取得劳动者的谅解，法院在量刑时可能会予以考虑，从而有可能免除刑事处罚。
三、法院免除刑事处罚的实践考量
社会效果与法律效果的统一：
- 法院在判决时，会综合考虑案件的社会效果和法律效果。如果免除刑事处罚能够更好地实现社会和谐稳定，同时又不违背法律原则，法院可能会倾向于免除刑事处罚。
量刑平衡与个案公正：
- 法院在量刑时，会考虑类似案件的判决情况，以保持量刑的平衡。同时，也会根据个案的具体情况，如犯罪嫌疑人的主观恶性、犯罪手段、犯罪后果等，进行公正的量刑。
四、建议与风险提示
对于犯罪嫌疑人：
- 如果涉嫌拒不支付劳动报酬罪，应尽快支付拖欠的劳动报酬，并积极配合调查，争取从轻或减轻处罚。
- 如有自首、立功等情节，应及时向司法机关说明，以便在量刑时予以考虑。
对于劳动者：
- 如果遭遇拒不支付劳动报酬的情况，应及时向劳动监察部门投诉或向公安机关报案，维护自己的合法权益。
- 在司法程序中，应积极配合调查，提供相关证据，以便司法机关能够准确认定犯罪事实，依法惩处犯罪嫌疑人。
总结来说，检察院起诉拒不支付劳动报酬罪后，法院是否免除刑事处罚需根据具体案情和法律规定综合判断。犯罪嫌疑人应积极支付劳动报酬、配合调查，争取从轻或减轻处罚；劳动者则应及时维权，配合司法程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。