发现被偷的电动车在修车店后，应立即采取以下措施处理：

1. 固定证据并报警：

   • 首先，不要擅自进入修车店或移动车辆，以免破坏现场或证据。
   • 立即拨打110报警，向警方说明情况，包括车辆被盗的时间、地点、车辆特征以及当前所在位置（修车店地址）。
   • 如果可能，拍摄现场照片或视频作为证据，特别是车辆在修车店内的位置、车辆状况以及修车店的相关标识。

2. 配合警方调查：

   • 等待警方到达现场后，积极配合警方的调查工作，提供车辆的相关信息，如购车发票、车辆登记证、车牌号等，以证明车辆的所有权。
   • 向警方详细描述车辆被盗的经过，包括可能的时间、地点、嫌疑人特征等，有助于警方快速破案。

3. 与修车店沟通：

   • 在警方在场的情况下，与修车店负责人沟通，了解车辆是如何被送到修车店的，以及修车店是否对车辆进行了任何维修或改动。
   • 要求修车店提供送修人的相关信息（如果可能），这有助于警方追踪嫌疑人。

4. 追回车辆并检查损失：

   • 在警方确认车辆为被盗车辆后，按照警方的指示，将车辆取回。
   • 取回车辆后，仔细检查车辆是否有损坏或丢失的部件，如有，及时记录并拍照留证。

5. 考虑法律追责：

   • 如果修车店在不知情的情况下接收了被盗车辆，且没有造成车辆进一步损坏或丢失，一般不需要承担法律责任。但如果有证据表明修车店与盗窃者有勾结或明知车辆为被盗而接收，则修车店可能构成掩饰、隐瞒犯罪所得罪，你可以考虑向警方提供线索，追究其法律责任。
   • 对于盗窃者，一旦被抓获，你将有权要求其赔偿车辆损失及因盗窃行为给你造成的其他损失。

6. 加强防范措施：

   • 此次事件后，建议加强车辆的防盗措施，如安装更高级的防盗锁、使用GPS定位设备等，以降低未来被盗的风险。