在国有企业互相合并的情况下，员工的处理方式及权益保障是一个涉及法律、经济和人力资源等多个层面的重要问题。以下是对此问题的详细解答：
一、劳动合同的处理与继续有效
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，当国有企业发生合并时，原劳动合同继续有效，由承继其权利和义务的新用人单位继续履行。这意味着，员工无需重新签订劳动合同，其工作岗位、薪酬待遇、工作地点等原则上应保持不变。这是保障员工权益的基本原则，确保了员工在合并过程中的工作稳定性。
二、员工安置方案的制定与实施
制定方案：在合并过程中，应制定详细的员工安置方案。该方案需经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。方案应涵盖人员去向、补偿标准、社保接续等重要事项，确保员工的知情权和参与权。
员工分流与安置：安置方案可能包括内部转岗、待岗、提前退休等多种方式。内部转岗是将员工调整到新企业内的其他合适岗位，以适应合并后的业务需求；待岗期间，企业需按规定发放生活费，保障员工的基本生活；符合条件的员工可申请提前退休，享受相应的退休待遇。
特殊情况处理：若员工不同意合并或要求解除劳动合同，企业应尊重员工意愿，依法进行协商或解除。若因此解除劳动合同，企业需支付相应的经济补偿，以保障员工的合法权益。
三、经济补偿的支付与标准
支付情形：当企业与员工协商一致解除劳动合同，或因法定原因导致劳动合同无法继续履行而解除时，企业需支付经济补偿。例如，因合并后的重大经营调整导致原合同无法履行，且双方未能就变更合同内容达成协议的情况。
补偿标准：经济补偿按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的按一年计算；不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。对于月工资高于当地职工月平均工资三倍的员工，按其月工资的三倍数额支付，最高不超过十二年。这里的月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
四、社会保险和住房公积金的接续
合并后的企业应及时办理员工的社会保险和住房公积金相关手续，确保缴纳不中断。员工的社保和公积金关系由新企业承继，继续按规定基数和比例缴纳。这是保障员工在养老、医疗、失业、工伤、生育等方面的权益以及住房公积金的相关权益的重要措施。
五、沟通与解释工作
及时告知：企业应及时向员工通报合并的相关信息，包括合并的原因、目的、影响以及后续安排等。这有助于消除员工的疑虑和不安，增强员工的信任感和归属感。
倾听反馈：鼓励员工提出问题和建议，积极回应员工的关切和需求。企业可以设立专门的沟通渠道，如员工座谈会、意见箱等，以便及时收集员工的反馈意见，并作出相应的调整和改进。
综上所述，国有企业互相合并时，员工的处理方式应严格依法进行，确保员工的合法权益得到充分保障。同时，企业应积极与员工沟通协商，制定合理的安置方案和经济补偿标准，以促进企业合并的顺利进行并维护社会稳定和谐。