保险公司与对方签订的协议，对车主是否有效需分情况讨论，具体如下：

1. 若协议内容涉及车主权利义务且车主授权或追认
   若保险公司与对方签订的协议内容直接涉及车主的权利义务（如赔偿金额、责任划分等），且车主事先明确授权保险公司代为签订协议，或事后对协议内容予以追认（如签字确认、接受赔偿款等），则该协议对车主具有法律约束力。此时，车主需按照协议约定履行义务或主张权利。

2. 若协议内容超出保险公司代理权限且车主未追认
   若保险公司未经车主授权，擅自与对方签订协议（如放弃车主的索赔权、约定车主承担额外责任等），且车主事后未追认该协议内容，则该协议对车主不发生效力。根据《民法典》第171条，未经被代理人追认的行为，对被代理人不发生效力，由行为人（保险公司）承担责任。此时，车主可主张协议无效，并要求对方或保险公司按实际损失重新协商或通过法律途径解决。

3. 若协议属于保险公司履行保险合同的常规操作
   在财产保险（如车险）中，保险公司通常根据保险合同约定，直接与第三方（如事故对方）协商赔偿事宜并签订协议。若协议内容符合保险合同约定（如赔偿范围、标准等），且未损害车主合法权益（如未免除保险公司应赔责任），则该协议对车主有效。车主需配合保险公司完成理赔流程，但无需对协议内容承担额外责任。

建议车主：

• 签订保险合同时，明确保险公司代为处理事故的权限范围（如是否可放弃索赔、是否可约定车主承担部分责任等）；
  
• 收到保险公司与对方签订的协议后，仔细核对内容是否与自身权益一致，如有异议及时提出；
  
• 若发现保险公司越权签订协议，可要求其重新协商或通过法律途径维护权益。
  

如有具体协议内容或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。