结论：企业是否应当支付农民工培训费，并不直接取决于农民工是否干满三个月，而是取决于双方之间的约定以及相关法律法规的规定。

分析说明：

1. 双方约定优先：

   • 如果农民工与企业之间在劳动合同或培训协议中明确约定了培训费用的支付条件、方式及期限，那么双方应当按照约定履行。例如，若协议中规定无论农民工是否干满三个月，企业均需支付培训费，则企业应遵守此约定。
   • 反之，如果协议中规定农民工需干满一定期限（如三个月）后，企业才支付培训费，且农民工未达到此期限，则企业可能无需支付或仅需支付部分培训费，具体取决于协议的具体条款。

2. 法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，企业为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但此规定主要关注的是服务期和违约金，并未直接规定培训费的支付条件。
   • 在实际操作中，如果企业未与农民工明确约定培训费的支付条件，且农民工未违反任何服务期约定或劳动合同条款，那么企业要求农民工支付培训费或因农民工未干满三个月而拒绝支付培训费，可能缺乏法律依据。

3. 公平原则与实际情况：

   • 即使双方未明确约定培训费的支付条件，企业在决定是否支付培训费时，也应考虑公平原则。如果农民工已经接受了企业的培训并从中受益，且未给企业造成损失，那么企业要求农民工全额承担培训费可能显得不公平。
   • 另外，如果农民工未干满三个月是因为企业原因（如违法解除劳动合同、未提供劳动条件等），那么企业更无权要求农民工承担培训费。

行动建议：

• 对于农民工：

  • 在签订劳动合同或培训协议时，务必仔细阅读并理解其中关于培训费的支付条款。
  • 如果对条款有疑问或不确定，应及时向企业或法律专业人士咨询。
  • 如果企业要求支付培训费但缺乏合法依据，可以拒绝支付或寻求法律援助。

• 对于企业：

  • 在制定劳动合同或培训协议时，应明确约定培训费的支付条件、方式及期限。
  • 确保约定条款合法、合理且公平，避免引起不必要的纠纷。
  • 如果农民工未干满约定期限，应根据实际情况和约定条款妥善处理培训费问题。

特殊场景：

• 如果农民工与企业之间存在争议，且无法通过协商解决，双方可以寻求劳动争议调解仲裁机构或法院的帮助，以维护自己的合法权益。

如有任何进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。