关于店铺被关闭时的损失赔偿标准，这确实是一个涉及多方面因素的问题，需要综合考虑具体情况以及合同中的相关约定。以下是我为您详细梳理的赔偿标准分析：
一、总体原则
合同约定优先：
- 首先，您需要仔细审查与店铺运营相关的所有合同，包括但不限于租赁合同、劳动合同、合作经营协议等。这些合同中可能明确规定了店铺关闭时的赔偿条款，如赔偿金额、计算方式或违约金等。如果合同中有具体规定，那么赔偿应严格按照合同条款来执行。
协商为主，法律为辅：
- 如果合同中没有明确规定赔偿标准，或者规定不够明确，那么双方应首先尝试通过友好协商来确定合理的赔偿数额。在协商过程中，应综合考虑店铺关闭的原因、各方的过错程度、实际损失情况以及公司的财务状况等因素。
- 如果协商不成，或者一方对协商结果不满意，那么可以通过法律途径来解决争议。在这种情况下，法院或仲裁机构会根据相关法律法规和实际情况来判定赔偿标准。
二、针对不同对象的赔偿标准
针对员工的赔偿：
- 如果店铺关闭导致劳动合同解除，公司需要按照《劳动合同法》的规定支付经济补偿。经济补偿的标准通常是根据员工在公司的工作年限和月工资来计算的。
- 如果公司擅自解除劳动合同，属于违法解除，需要支付赔偿金，赔偿金标准通常是经济补偿标准的二倍。
针对房东的赔偿：
- 如果店铺关闭导致租赁合同提前解除，赔偿事宜应根据租赁合同中的约定来确定。如果合同中有明确的违约金或赔偿计算方式，那么应按照合同来执行。
- 如果公司未经房东同意擅自撤店，构成单方违约，需要承担违约责任。赔偿标准通常应相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可获得的利益，但不得超过违约一方订立合同时预见到的可能损失。
针对合作伙伴的赔偿：
- 如果公司与合作伙伴之间有合作经营协议，且协议中对店铺关闭等情况有明确约定，那么应按照协议进行赔偿。赔偿标准可能包括约定的违约金及对方因店铺关闭而遭受的直接经济损失。
- 如果无书面协议或协议中无店铺关闭赔偿约定，双方应协商补充约定。协商不成时，可以按照合同相关条款或交易习惯来确定赔偿标准。在这种情况下，公司仍需赔偿对方因店铺关闭所遭受的实际损失，包括可得利益的损失。
三、实际操作建议
保持沟通：
- 在处理店铺关闭赔偿问题时，各方应保持有效沟通，尽量通过协商达成一致意见。这有助于减少争议和冲突，促进问题的妥善解决。
寻求专业帮助：
- 如果赔偿问题比较复杂或涉及金额较大，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询和代理服务，帮助您更好地维护自己的合法权益并确保赔偿标准的合理性与合法性。
综上所述，店铺被关闭时的损失赔偿标准需要根据具体情况及合同约定来确定。在处理赔偿问题时，各方应遵循合同约定优先、协商为主、法律为辅的原则，并保持有效沟通以寻求专业帮助。希望这些信息能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。