结论：离职证明上显示的是分公司劳动合同，但向总公司投诉公积金问题是否有效，需根据具体情况判断，若分公司具有独立法人资格，一般应向分公司投诉；若分公司不具有独立法人资格，则可向总公司投诉。以下为详细分析：

一、分公司与总公司的法律关系

1. 独立法人资格：

   • 如果分公司具有独立的法人资格，那么它就是一个独立的法律主体，能够独立承担民事责任。在这种情况下，公积金的缴纳、管理等相关事宜通常由分公司自行负责。
   • 若分公司未按照规定缴纳公积金，劳动者应直接向分公司进行投诉或申请劳动仲裁，要求分公司补缴公积金。

2. 非独立法人资格：

   • 如果分公司不具有独立的法人资格，那么它实际上是总公司的一个分支机构，其民事责任由总公司承担。
   • 在这种情况下，如果分公司未按照规定缴纳公积金，劳动者可以向总公司进行投诉或申请劳动仲裁，要求总公司承担补缴公积金的责任。

二、投诉公积金问题的途径

1. 向分公司投诉：

   • 如果分公司具有独立法人资格，且劳动者认为分公司未按照规定缴纳公积金，那么劳动者应首先向分公司进行投诉。
   • 投诉时，劳动者应提供相关证据，如劳动合同、工资单、公积金缴纳记录等，以证明分公司存在未缴纳或未足额缴纳公积金的情况。

2. 向总公司投诉：

   • 如果分公司不具有独立法人资格，或者劳动者认为分公司无法独立承担补缴公积金的责任，那么劳动者可以向总公司进行投诉。
   • 同样，投诉时劳动者应提供相关证据，以证明总公司或其分支机构（分公司）存在未缴纳或未足额缴纳公积金的情况。

三、实际操作建议

1. 了解分公司法律地位：

   • 在投诉前，劳动者应首先了解分公司的法律地位，即是否具有独立法人资格。这可以通过查询工商登记信息、咨询法律专业人士等方式进行。

2. 收集证据：

   • 无论向分公司还是总公司投诉，劳动者都应收集相关证据，以证明存在未缴纳或未足额缴纳公积金的情况。这些证据可以包括劳动合同、工资单、公积金缴纳记录等。

3. 选择合适的投诉途径：

   • 根据分公司的法律地位和实际情况，劳动者应选择合适的投诉途径。如果分公司具有独立法人资格，且能够独立承担民事责任，那么应向分公司投诉；如果分公司不具有独立法人资格，或者劳动者认为分公司无法独立承担责任，那么应向总公司投诉。

4. 寻求法律帮助：

   • 如果劳动者在投诉过程中遇到困难或问题，可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为劳动者提供法律咨询、代理投诉或申请劳动仲裁等服务。

最后，离职证明上显示的是分公司劳动合同，并不影响劳动者向总公司或分公司投诉公积金问题的权利。关键在于了解分公司的法律地位和实际情况，并选择合适的投诉途径。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。