工资已全部结清证明上有员工签名，并不直接等同于双方协商一致解除了劳动合同。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
协商一致解除劳动合同的法定要件：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。但这一协商一致的过程，通常需要双方有明确的解除劳动合同的合意，并且可能涉及解除劳动合同的时间、经济补偿等条款的协商。
- 工资结清证明，主要证明的是用人单位已经支付了劳动者应得的工资，它并不直接包含解除劳动合同的合意。
工资结清证明与解除劳动合同证明的区别：
- 工资结清证明是用人单位证明已支付劳动者工资的文件。
- 解除劳动合同证明则是用人单位与劳动者解除劳动关系后，由用人单位出具的证明双方劳动关系已经终止的文件，其中会明确解除劳动合同的原因、时间等关键信息。
实践角度
员工签名的含义：
- 员工在工资结清证明上签名，通常仅表示其确认收到了应得的工资，并不直接表示其同意解除劳动合同。
- 如果用人单位意图通过工资结清证明来证明双方已协商一致解除劳动合同，那么需要在证明中明确包含这一意思表示，或者另行签订解除劳动合同的协议。
潜在的法律风险：
- 如果用人单位仅凭工资结清证明上有员工签名就主张双方已协商一致解除劳动合同，而劳动者对此予以否认，那么用人单位可能面临支付违法解除劳动合同赔偿金的风险。
- 劳动者在签署任何文件时，都应仔细阅读文件内容，确保自己了解并同意文件中的条款，避免因误解或疏忽而引发不必要的法律纠纷。
建议
对于用人单位：
- 如果希望与劳动者协商一致解除劳动合同，应另行签订解除劳动合同的协议，明确双方的权利义务，包括解除劳动合同的时间、经济补偿等条款。
- 在支付工资时，可以要求劳动者签署工资结清证明，但应确保该证明不包含与解除劳动合同相关的内容，或者明确说明该证明仅用于证明工资支付情况。
对于劳动者：
- 在签署任何文件时，都应仔细阅读文件内容，特别是关于解除劳动合同、经济补偿等关键条款。
- 如果对文件内容有疑问或不同意其中的条款，应及时与用人单位沟通并寻求法律帮助。
总结来说，工资已全部结清证明上有员工签名，并不直接等同于双方协商一致解除了劳动合同。用人单位和劳动者在处理劳动关系时，都应遵循法律法规的规定，确保双方的权利义务得到明确和保障。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。