结论：公司不肯在离职证明上注明是公司解除劳动关系，这种做法是不合法的。你可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 离职证明的法律要求：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这一规定明确了用人单位在解除劳动关系时有出具离职证明的法定义务。
   • 离职证明应当写明劳动合同期限、解除或者终止劳动合同的日期、工作岗位、在本单位的工作年限等内容，其中自然包括解除劳动关系的原因。如果公司解除劳动关系，离职证明上应当明确注明这一点。

2. 公司行为的违法性：

   • 公司不肯在离职证明上注明是公司解除劳动关系，这种做法违反了上述法律规定，剥夺了劳动者获取真实离职信息的权利。
   • 这种行为可能出于多种目的，如试图逃避法律责任、掩盖不当解雇行为等，但无论何种原因，都不能成为公司违反法律规定的借口。

3. 你的应对措施：

   • 与公司协商：首先，你可以尝试与公司进行协商，要求公司按照法律规定出具正确的离职证明。在协商过程中，你可以明确指出公司的行为违反了法律规定，并要求公司立即改正。
   • 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉公司的违法行为。劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求公司改正违法行为。
   • 申请劳动仲裁：如果公司仍然拒绝出具正确的离职证明，你可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。在仲裁过程中，你需要提供相关证据证明公司解除劳动关系的事实，以及公司拒绝出具正确离职证明的行为。劳动仲裁机构将根据事实和法律规定作出裁决，要求公司出具正确的离职证明。

4. 可能面临的法律后果：

   • 如果公司最终被认定存在违法行为，可能需要承担法律责任，包括但不限于出具正确的离职证明、赔偿因违法行为给你造成的损失等。
   • 同时，公司的违法行为也可能对其声誉和信誉造成负面影响，影响其在市场上的竞争力和形象。

建议：

• 在处理此类问题时，建议你保持冷静和理性，不要采取过激行为或言语攻击公司。
• 尽可能收集并保存好与解除劳动关系相关的证据，如劳动合同、解除通知、工资单等，以便在需要时提供证明。
• 如果你对法律程序不熟悉或感到困惑，可以随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。