当监理发现农民工数量不符合实际情况时，这是一个需要高度重视并妥善处理的问题，因为它不仅关乎农民工的合法权益，也影响到工程项目的合规性和稳定性。以下是我建议监理应采取的详细步骤和措施：

一、核实情况，确认差异

1. 详细比对：首先，监理应详细比对实际到场的农民工数量与报备或合同中约定的数量，确认是否存在差异。
2. 记录证据：在比对过程中，监理应记录好相关证据，如考勤记录、工资发放记录、现场照片或视频等，以便后续处理。

二、分析原因，明确责任

1. 分析差异原因：监理应与施工单位进行沟通，了解农民工数量不符的具体原因，是人员流动、误报、还是其他特殊情况。
2. 明确责任主体：根据分析结果，明确责任主体。如果是施工单位管理不善或故意隐瞒，应要求其承担相应责任；如果是其他不可抗力因素导致，也应做好记录并妥善处理。

三、采取措施，纠正问题

1. 要求施工单位整改：监理应要求施工单位立即整改，确保农民工数量符合实际情况。如果施工单位无法立即整改，应制定整改计划并明确整改期限。
2. 加强现场监管：在整改期间，监理应加强对施工现场的监管，确保农民工的合法权益得到保障，如工资按时发放、劳动条件符合标准等。
3. 报告相关部门：如果问题严重或施工单位不配合整改，监理应及时向当地劳动保障监察部门或相关行业主管部门报告，寻求政府部门的支持和协助。

四、完善制度，预防类似问题

1. 完善报备制度：监理应建议施工单位完善农民工报备制度，确保农民工数量、身份信息等准确无误。
2. 加强日常巡查：监理应加强对施工现场的日常巡查，及时发现并纠正类似问题，防止问题扩大化。
3. 建立长效机制：监理应与施工单位共同建立预防和解决拖欠农民工工资问题的长效机制，如设立农民工工资专用账户、实行工资保证金制度等，确保农民工的合法权益得到长期保障。

五、法律与政策依据

在处理此类问题时，监理还应了解并遵循相关法律法规和政策要求，如《保障农民工工资支付条例》等。这些法规为监理提供了明确的指导和依据，有助于监理更好地履行职责，保障农民工的合法权益。

综上所述，当监理发现农民工数量不符合实际情况时，应通过核实情况、分析原因、采取措施、完善制度和遵循法律与政策依据等步骤来妥善处理问题。这样不仅能保障农民工的合法权益，也能维护工程项目的合规性和稳定性。