没有房产证只有开发区的协议，其效力需分情况讨论：

1. 协议本身的效力
   从合同法的角度来看，只要开发区协议是双方真实意思表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定（如土地管理法、城乡规划法等），且不存在欺诈、胁迫等情形，协议本身是有效的。这意味着双方需按协议约定履行义务，例如支付款项、交付房屋等。但需注意：

   • 若协议涉及未经批准的集体土地开发、小产权房交易等违法情形，可能被认定为无效合同。
     
   • 若协议条款模糊（如未明确房屋交付标准、产权归属等），可能引发后续纠纷。

2. 对房屋产权的影响
   房产证是房屋所有权的法定证明。仅有开发区协议，无法直接取得房屋产权。若后续无法办理房产证，可能面临以下风险：

   • 无法对抗第三人：若开发商将房屋再次出售或抵押，买方可能因无房产证而丧失所有权。
     
   • 拆迁补偿风险：在拆迁中，无房产证的房屋可能被认定为违法建筑，补偿标准可能低于合法房屋。
     
   • 继承、转让困难：无房产证的房屋难以通过法律程序完成继承或转让。

3. 实务建议

   • 核查协议内容：确认协议是否明确约定了产权办理条款（如开发商承诺在一定期限内办理房产证），并保留付款凭证、交房手续等证据。
     
   • 咨询行政机关：向当地不动产登记中心或规划部门核实房屋是否具备办理房产证的条件（如土地性质、规划许可等）。
     
   • 法律救济途径：若开发商违约（如未按时办证），可依据协议要求其承担违约责任（如赔偿损失、解除合同等）；若协议无效，可要求返还已付款项并主张赔偿。

总结：开发区协议的效力需结合合同内容和法律规定判断，但无房产证始终是产权瑕疵。建议优先通过协商或法律途径推动产权办理，必要时委托律师介入处理。若有具体协议条款或案件细节，可进一步向我咨询。