针对您提出的“如果公司员工请病假时间太长怎么处理”的问题，这是一个涉及员工权益与企业管理平衡的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们要明确的是，员工享有合法的休息休假权，这包括病假。当员工因病需要请假时，他们有权根据医疗机构出具的病假证明向公司申请病休。然而，这一权利的行使并非无限制的，它应当受到相应的约束，以确保公司的正常运营秩序不受过度干扰。

针对员工长期请病假的情况，公司可以采取以下措施来合理应对：

1. 复核病假证明：

   • 公司可以在制度中明确规定，有权对员工的病假证明进行复核。
   • 要求员工提交病历本、病假证明、医药费单据等，以审查病假的真实性。
   • 若公司对员工的病假有合理怀疑，可以在符合规章制度及不违背合理性、便利性、公平性的前提下，要求员工到指定医院进行复查。

2. 明确病假证明要求：

   • 让员工提交符合规定的医院医生开具的病假证明，并附注医生的姓名和联系方式，以便公司进行核实。

3. 定期探访生病员工：

   • 定期探访生病员工不仅体现了公司对员工的关爱，还能起到对员工病假正常监控的作用。
   • 通过探访，公司可以了解员工的实际病情和康复情况，为后续的用工安排提供依据。

4. 明确规章制度：

   • 在公司的规章制度中明确虚假病假属于严重违反公司制度的行为，一经发现可以辞退。
   • 这有助于维护公司的用工秩序，防止员工滥用病假权利。

5. 合理处理长期病假员工：

   • 对于无正当理由长期休病假的员工，公司不能直接以旷工为由解除劳动合同，但可以根据公司的规章制度和实际情况，采取相应的措施。
   • 如案例中所述，若员工在病假期间拒绝公司合理的返岗要求、擅自更换医院重新出具病假资料、病假期间隐瞒多次外出情形等，这些行为已经违反了劳动者应当遵守的劳动纪律和职业道德。在此情况下，公司有权根据规章制度解除劳动合同，且这种解除是合法的。

6. 平衡各方权利义务：

   • 在处理长期休病假而导致的用工纠纷时，公司应秉持公平公正的原则。
   • 既要保护员工合法的休息休假权利，也要关注公司出于合理怀疑对于病假情况作出的各项调查。
   • 结合公司的规章制度以及民法诚实信用原则，综合判断案情，掌握审判尺度，平衡各方权利义务。

综上所述，公司对于员工长期请病假的情况应采取审慎而合理的措施。通过复核病假证明、明确病假证明要求、定期探访生病员工、明确规章制度以及合理处理长期病假员工等方式，公司可以在保护员工权益的同时，维护自身的正常运营秩序。