两个养殖场因距离太近发生争执，通常由农业农村部门（或畜牧兽医部门）牵头处理，涉及环境污染时可由生态环境部门介入，若引发治安或刑事案件则由公安机关处理。具体分析如下：

1. 农业农村部门（或畜牧兽医部门）的主管职责
   根据《畜牧法》及地方性养殖管理条例，农业农村部门是养殖行业的主管部门，负责养殖场规划、布局、防疫及纠纷调解。若争执核心是养殖场间距是否符合防疫要求（如《动物防疫条件审查办法》规定的“动物饲养场之间距离不少于500米”），或涉及养殖行为合规性（如噪音、气味影响），农业农村部门有权通过行政指导、责令整改或组织协商解决。

2. 生态环境部门的介入条件
   若争执涉及养殖污染（如废水、废气排放超标），根据《环境保护法》及《水污染防治法》，生态环境部门可对养殖场进行环境监测，认定污染事实后依法处罚（如罚款、限期治理），并可要求养殖场承担民事赔偿责任。此时，生态环境部门与农业农村部门可能联合处理。

3. 公安机关的管辖范围
   若争执升级为肢体冲突、毁坏财物等治安案件，或涉嫌故意伤害、破坏生产经营等刑事犯罪，公安机关将依据《治安管理处罚法》或《刑法》立案查处。例如，一方养殖场故意堵塞对方排水管道导致牲畜死亡，可能构成破坏生产经营罪。

4. 民事纠纷的诉讼途径
   若争执涉及相邻权侵害（如通风、采光、排水受阻），或要求赔偿因污染导致的经济损失，当事人可依据《民法典》第288条（相邻关系处理原则）向法院提起民事诉讼，要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。

建议行动步骤：

1. 优先向当地农业农村部门举报养殖场间距或防疫问题，要求行政干预；
   
2. 若存在污染，同步向生态环境部门投诉并申请环境监测；
   
3. 若发生人身或财产损害，立即报警并保留证据（如照片、视频、医疗记录）；
   
4. 复杂纠纷可委托律师起草《律师函》或提起民事诉讼，通过法律程序明确责任。
   

如有进一步细节（如争执具体原因、是否已发生损害结果），可向我补充说明，我将提供更精准的解决方案。