针对您提出的事业单位工作人员缓刑2年期满后又工作三年如何退还工资的问题，这确实是一个涉及多个因素和法规的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，事业单位工作人员在缓刑期间的工资待遇处理是有明确规定的。根据《关于事业单位工作人员和机关工人被采取强制措施和受行政刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》等相关法规，如果工作人员在缓刑期间未被开除公职，那么其原工资将被停发，并改为发放生活费，这个生活费的标准通常由各地制定，且会低于原工资水平。

现在，针对您的情况，即缓刑2年期满后又工作了三年，我们需要考虑几个关键点：

1. 缓刑期间是否被开除公职：

   • 如果缓刑期间未被开除公职，那么缓刑期间停发的是原工资，发放的是生活费。缓刑期满后，如果继续在事业单位工作，其工资待遇应按照事业单位的薪酬体系重新确定，而不是简单地“退还”缓刑期间停发的工资。
   • 如果缓刑期间被开除公职，那么从判决生效之日起，原工资待遇即被取消，与事业单位的人事关系也终止。此后，如果再次被事业单位聘用，其工资待遇将按照新聘用单位的薪酬体系确定。

2. 缓刑期满后的工作情况：

   • 缓刑期满后，如果工作人员继续在事业单位工作，并且没有再次违法违纪，那么其工资待遇应按照事业单位的正常薪酬体系进行调整和发放。
   • 如果缓刑期间或期满后有违法违纪行为，可能会面临进一步的处分，包括开除公职等，这将直接影响其后续的工资待遇。

3. 关于“退还工资”的理解：

   • 在这里，“退还工资”可能是一个误解。实际上，缓刑期间停发的是原工资，发放的是生活费，这是法律规定的处理方式，不存在“退还”的问题。
   • 如果您是指希望恢复缓刑期间的工资待遇或补发工资，这通常是不可能的，除非有再审改判无罪等特殊情况。

4. 建议与行动：

   • 鉴于您的情况比较复杂，我建议您首先咨询所在单位的人事部门，了解具体的薪酬政策和处理方式。
   • 同时，您也可以查阅相关的法律法规，如《关于事业单位工作人员和机关工人被采取强制措施和受行政刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》等，以更全面地了解自己的权益和义务。

综上所述，事业单位工作人员在缓刑期间的工资待遇处理是有明确规定的，缓刑期满后的工资待遇应按照事业单位的薪酬体系重新确定。不存在简单地“退还”缓刑期间停发的工资的情况。希望以上解答能够帮助您更好地理解这个问题。