关于“让员工查传染病是否违法”的问题，结论如下：

1. 一般情况下，用人单位无权强制要求员工进行传染病检查，此行为可能违法
   根据《中华人民共和国就业促进法》和《传染病防治法》，用人单位不得歧视传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人，也不得强制要求员工进行传染病检查（除非法律、行政法规或国务院卫生行政部门另有规定）。若用人单位未经员工同意，擅自要求其进行传染病检查，可能构成对员工隐私权和人格尊严的侵犯，属于违法行为。

2. 特定情况下，用人单位可要求员工进行传染病检查，但需严格遵守法律程序
   若用人单位或从事的岗位属于法律法规明确禁止传染病病原携带者从事的单位或工作（如食品加工、医疗卫生等），且该传染病可能对其他员工的健康安全构成直接威胁，或使员工无法正常履行工作职责，用人单位在遵循法定程序（如提前告知员工检查的必要性、目的和法律依据，并获得员工同意）后，可以要求员工进行传染病检查。但即便如此，用人单位也需确保检查的合法性和必要性，避免滥用权力。

详细分析：

• 法律背景：
  《中华人民共和国就业促进法》第三十条规定：“用人单位招用人员，不得以是传染病病原携带者为由拒绝录用。但是，经医学鉴定传染病病原携带者在治愈前或者排除传染嫌疑前，不得从事法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使传染病扩散的工作。”
  《传染病防治法》第十六条规定：“任何单位和个人不得歧视传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人。传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人，在治愈前或者在排除传染病嫌疑前，不得从事法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作。”

• 法律建议：

  1. 用人单位角度：

     • 除非法律、行政法规或国务院卫生行政部门另有规定，否则不得强制要求员工进行传染病检查。
       
     • 若因工作需要必须要求员工进行传染病检查，应提前告知员工检查的必要性、目的和法律依据，并获得员工同意。
       
     • 确保检查的合法性和必要性，避免滥用权力或侵犯员工隐私权。
       

  2. 员工角度：

     • 若用人单位未经同意要求进行传染病检查，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。
       
     • 若员工因传染病被用人单位违法辞退或歧视，可以向企业劳动争议调解委员会申请调解，或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼，以维护自身合法权益。

可能的法律后果：

• 若用人单位违法强制要求员工进行传染病检查，可能面临劳动监察部门的处罚，包括警告、罚款等。
  
• 若员工因传染病被用人单位违法辞退或歧视，用人单位需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。赔偿金的计算依据劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准。

举例说明：
假设某食品加工企业未经员工同意，擅自要求所有员工进行艾滋病检查，否则将予以辞退。此行为即属于违法强制要求员工进行传染病检查，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。若企业因此辞退员工，员工还可以通过法律途径要求企业支付赔偿金。

总结：
用人单位在要求员工进行传染病检查时，必须严格遵守相关法律法规，确保检查的合法性和必要性。同时，员工也应充分了解自身权益，通过合法途径维护自身利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。