结论前置：公司要求员工进行性传染病检查是否合法，需根据具体情况判断。一般情况下，公司无权强制员工进行此类检测，否则可能侵犯员工的隐私权和个人信息权；但在特定行业或工种中，基于公共安全、法律规定等正当理由，进行此类检测可能是合法的。
详细分析：
一般情况下的违法性：
- 根据相关法律法规，员工的隐私权和个人信息权受法律保护。未经员工同意，公司不得擅自要求员工进行性传染病检查，否则将构成对员工隐私权和个人信息权的侵犯。
- 入职体检等常规体检项目中，通常不包含性传染病检测。如果公司自行增加此类检测项目并进行检查，且未征得员工同意，那么这种行为很可能是违法的。
特殊职业岗位的合法性：
- 对于某些特殊的职业岗位，如医疗、食品、公共卫生等行业，或者某些直接接触公众、可能传播疾病的岗位，出于公共安全、法律规定等正当理由，可能需要进行包括性传染病在内的特定传染病检查。
- 但这种检查必须依据相关法律法规和政策的明确规定，并在程序上遵循合法、合规的要求。例如，必须确保员工的知情权，向员工说明检查的目的、意义及可能的结果，并获得员工的明确同意。同时，检查结果应严格保密，仅用于必要的公共卫生目的。
员工权益保护：
- 如果员工认为公司的性传染病检查行为侵犯了自己的合法权益，首先应与公司进行沟通协商，要求其停止侵权行为或提供合理的解释和依据。
- 协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径（如提起诉讼）来维护自己的权益。在维权过程中，员工应保留好相关证据，如公司的通知、检查记录等，以便在需要时提供证明。
法律建议：
- 对于公司而言，应谨慎处理员工的健康检查问题，避免侵犯员工的隐私权和个人信息权。如果需要进行特定传染病检查，应确保有明确的法律依据和合理的理由，并在程序上遵循合法、合规的要求。
- 对于员工而言，如果遇到公司要求进行性传染病检查的情况，应首先了解自己的权益和法律规定，然后与公司进行沟通协商。如果认为公司的行为违法或侵犯了自己的权益，应及时采取措施维护自己的合法权益。
总结：公司在要求员工进行性传染病检查时，需结合具体情境来判断其合法性。在一般情况下，公司无权强制员工进行此类检测；但在特定行业或工种中，基于合法、合规的考虑，进行此类检测可能是必要的。无论何种情况，都应充分尊重和保护员工的隐私权和个人信息权。如果权益受到侵害，员工应依法维权。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。