您好，关于工伤科是否可以要求公司出具员工入职证明的问题，这主要取决于工伤认定的具体流程和所需材料。
首先，我们要明确的是，在申请工伤认定时，确实需要提供与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料。这是工伤认定过程中的一个重要环节，旨在确认受伤员工与用人单位之间的法律关系，从而确定工伤认定的适用性和责任归属。
对于公司出具的入职证明，它通常是证明员工与用人单位存在劳动关系的一种有效方式。然而，如果公司拒绝出具入职证明，或者员工无法从公司获取该证明，这并不意味着员工就无法申请工伤认定。在实际操作中，人力资源和社会保障部门会参照其他证据来确定事实劳动关系，如工资支付凭证或记录、工作证、招工登记表、考勤记录以及其他劳动者的证言等。
具体来说，如果员工在申请工伤认定时遇到了公司不配合出具入职证明的情况，可以采取以下措施：
收集其他证据：如前所述，员工可以收集工资支付记录、工作证、考勤记录等其他能够证明与用人单位存在劳动关系的证据。
向劳动监察部门投诉：如果公司无正当理由拒绝出具入职证明，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其协助获取相关证据或进行调解。
直接申请工伤认定：在收集到足够证据后，员工可以直接向用人单位所在地统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。即使公司未出具入职证明，只要员工能够提供其他充分证据证明与用人单位存在劳动关系，社会保险行政部门仍然会受理工伤认定申请。
综上所述，工伤科在申请工伤认定过程中，虽然入职证明是一种有效的劳动关系证明材料，但并非唯一材料。如果公司拒绝出具入职证明，员工可以通过收集其他证据、向劳动监察部门投诉或直接申请工伤认定等方式来维护自己的合法权益。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。