在车辆使用人承认是挂靠车辆但未提交证据的情况下，我们可以从以下几个角度来分析和处理这一问题：
法律关系的认定：
- 挂靠关系的法律性质：挂靠关系通常涉及两个主体，即挂靠方（车辆实际使用人）和被挂靠方（名义车主或运营单位）。挂靠方以被挂靠方的名义进行运营活动，并支付一定的挂靠费用。这种关系在法律上可能被视为一种合同关系或合作关系，具体取决于双方之间的协议内容。
- 证据的重要性：在法律纠纷中，证据是认定事实的关键。如果车辆使用人承认是挂靠车辆，但未能提供书面合同、挂靠费用支付凭证、运营记录等证据来支持其主张，那么这一承认可能难以被法院或仲裁机构直接采纳。
处理策略：
- 收集间接证据：尽管车辆使用人未直接提交挂靠关系的证据，但可以尝试收集其他间接证据来支持其主张。例如，可以查找与被挂靠方的通信记录、证人证言、车辆运营过程中的相关文件等，这些证据可能间接证明挂靠关系的存在。
- 申请法院或仲裁机构调查取证：如果车辆使用人确实无法自行收集到足够证据，可以向法院或仲裁机构提出申请，请求其依职权调查取证。法院或仲裁机构有权根据案件需要，要求相关方提供证据或进行调查。
- 协商与调解：在诉讼或仲裁前，双方可以尝试通过协商或调解来解决争议。这不仅可以节省时间和成本，还可以避免法律程序带来的不确定性。在协商或调解过程中，车辆使用人可以充分利用其承认挂靠关系的事实，争取更有利的解决方案。
风险提示：
- 承认的法律后果：车辆使用人承认是挂靠车辆，但未提交证据，可能面临其主张不被法院或仲裁机构采纳的风险。这可能导致车辆使用人在争议解决中处于不利地位，甚至可能承担不利的法律后果。
- 证据保存的重要性：为了避免类似情况的发生，车辆使用人在日常运营中应妥善保存与挂靠关系相关的所有证据。这包括书面合同、支付凭证、通信记录等，以便在需要时能够提供充分的证据支持其主张。
总结建议：车辆使用人应尽快收集与挂靠关系相关的间接证据，并考虑向法院或仲裁机构申请调查取证。同时，也可以尝试与对方进行协商或调解，以寻求更快速、更经济的解决方案。在处理此类问题时，务必注意证据的保存和收集，以降低法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。