与机械设备加工厂签订的施工协议，在符合法定条件时是有效的。以下从不同角度对这一问题进行详细分析：

一、协议有效的基本条件

1. 主体适格：

   • 签订协议的双方必须具备相应的民事行为能力。对于机械设备加工厂而言，它应是一个依法设立并具备独立法人资格或合法经营资格的实体。
   • 另一方（即您或您的公司）也应具备签订合同的民事行为能力，如为自然人，则需具备完全民事行为能力；如为公司，则需具备法人资格。

2. 意思表示真实：

   • 协议双方在签订协议时，必须出于真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。
   • 协议内容应明确、具体，且双方对协议内容无异议。

3. 内容合法：

   • 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。
   • 对于施工协议而言，应明确施工范围、工期、质量标准、价款及支付方式等关键条款，且这些条款应符合相关法律法规的规定。

4. 形式合法：

   • 根据《民法典》的相关规定，某些类型的合同需要采用书面形式。对于施工协议而言，由于其涉及较大的经济利益和复杂的权利义务关系，通常建议采用书面形式签订，以明确双方的权利义务，避免纠纷的发生。

二、可能影响协议效力的因素

1. 无权代理或越权代理：

   • 如果签订协议的一方（如机械设备加工厂的代表）未经授权或超越权限签订协议，且事后未得到追认，则该协议可能对被代理人不发生效力。

2. 恶意串通损害他人利益：

   • 如果协议双方恶意串通，损害国家、集体或第三人的利益，则该协议无效。

3. 以合法形式掩盖非法目的：

   • 如果协议双方以签订施工协议为形式，实则进行非法活动（如洗钱、逃税等），则该协议无效。

三、法律建议

1. 审查对方资质：

   • 在签订施工协议前，应仔细审查机械设备加工厂的营业执照、资质证书等相关文件，确保其具备签订和履行协议的能力。

2. 明确协议条款：

   • 协议应明确施工范围、工期、质量标准、价款及支付方式等关键条款，并约定违约责任和争议解决方式。

3. 采用书面形式：

   • 建议采用书面形式签订施工协议，以便在发生纠纷时提供有力的证据支持。

4. 咨询专业律师：

   • 在签订施工协议前，如有条件，可咨询专业律师的意见，以确保协议的合法性和有效性。

如果您在与机械设备加工厂签订施工协议过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。