结论：每天考勤打卡十二个小时是否合理合法，需结合具体的工作时间安排、加班情况以及是否支付了加班费等因素综合判断。一般情况下，若每天工作十二小时且未支付加班费或未安排补休，则可能违反劳动法规定。以下从不同角度详细分析：

一、法律规定的工作时间与加班限制

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定：

1. 标准工作时间：劳动者每日工作时间不超过八小时，平均每周工作时间不超过四十四小时。这是法律设定的标准工作时间上限。

2. 加班限制：用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。

二、十二小时工作制的合法性分析

1. 若未支付加班费或未安排补休：

   • 如果员工每天实际工作十二小时，且用人单位未按照法律规定支付加班费或未安排补休，则这种工作制显然违反了劳动法的规定。
   • 加班费支付标准：工作日加班，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日加班且不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日加班的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

2. 若已支付加班费或已安排补休：

   • 即使员工每天工作十二小时，但如果用人单位已经按照法律规定支付了加班费或安排了补休，且总加班时间未超过每月三十六小时的限制，则这种工作制在法律上可能是被允许的。
   • 但需注意，即使支付了加班费或安排了补休，长期的高强度工作也可能对员工的身心健康造成不利影响，用人单位应尽可能合理安排工作时间，避免过度加班。

三、特殊情况下的工作时间安排

在某些特殊行业或岗位，如医疗、交通、能源等，由于工作性质的特殊性，可能需要实行不定时工作制或综合计算工时工作制。但即使在这些情况下，用人单位也需要经过劳动行政部门的批准，并确保劳动者的平均工作时间不超过法定标准工作时间，且应支付相应的加班费或安排补休。

四、法律建议

1. 对于员工：

   • 如果发现自己的工作时间超过了法定标准，且未获得相应的加班费或补休，可以向用人单位提出异议，并要求按照法律规定支付加班费或安排补休。
   • 如果用人单位拒绝改正，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

2. 对于用人单位：

   • 应严格遵守劳动法的规定，合理安排员工的工作时间，避免过度加班。
   • 如需延长工作时间，应与员工协商并支付相应的加班费或安排补休。
   • 考虑员工的身心健康和工作效率，尽可能实行弹性工作制或轮班制等灵活的工作安排。

最后，每天考勤打卡十二个小时是否合理合法，需根据具体情况判断。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。