结论：能否以2024年度违纪被查为由辞退员工，需根据违纪行为的性质、严重程度以及公司规章制度的具体规定来综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、违纪行为的性质与严重程度
一般违纪行为：
- 如果员工的违纪行为属于一般性质，如偶尔迟到、早退，或者工作态度不积极等，且未对公司造成重大损失或影响，那么公司通常不能直接以此为由辞退员工。
- 在这种情况下，公司应首先通过警告、罚款、扣分等内部管理措施进行纠正，并给予员工改进的机会。
严重违纪行为：
- 如果员工的违纪行为严重到违反了公司的规章制度，或者触犯了法律法规，如盗窃、贪污、泄露公司机密等，那么公司有权根据规章制度或法律法规的规定，解除与员工的劳动合同。
- 在这种情况下，公司需要确保有充分的证据证明员工的违纪行为，并且按照法定程序进行辞退，如提前通知、听取员工申辩等。
二、公司规章制度的具体规定
规章制度的内容：
- 公司应制定明确的规章制度，规定哪些行为属于违纪行为，以及相应的处罚措施。
- 规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知，以确保员工对规章制度的内容有充分的了解。
规章制度的执行：
- 在执行规章制度时，公司应确保公平、公正、公开，避免对员工进行不公正的处罚。
- 如果公司以违纪为由辞退员工，但规章制度中未明确规定该违纪行为对应的处罚措施为辞退，或者规章制度本身存在违法之处，那么公司的辞退行为可能被认定为违法解除劳动合同。
三、法律建议与风险防范
完善规章制度：
- 公司应定期审查并更新规章制度，确保其符合法律法规的规定，并明确规定各种违纪行为及其对应的处罚措施。
- 规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知，以增强其合法性和有效性。
依法辞退员工：
- 如果公司决定辞退违纪员工，应确保有充分的证据证明员工的违纪行为，并按照法定程序进行辞退。
- 在辞退过程中，公司应尊重员工的合法权益，如听取员工申辩、支付经济补偿等（如果适用）。
风险防范：
- 为避免因辞退员工而引发的法律纠纷，公司可以在辞退前咨询专业律师的意见，确保辞退行为的合法性和合理性。
- 同时，公司应加强与员工的沟通和交流，及时了解员工的思想动态和工作情况，以便及时发现并纠正员工的违纪行为。
举例说明：假设某公司员工因多次迟到、早退且未经批准擅自离岗，被公司认定为严重违反规章制度。如果公司的规章制度中明确规定了此类行为属于严重违纪，并规定了相应的处罚措施为辞退，且该规章制度已经过民主程序制定并向员工公示或告知，那么公司有权以此为由辞退该员工。但如果公司的规章制度中未明确规定此类行为的处罚措施为辞退，或者规章制度本身存在违法之处，那么公司的辞退行为可能被认定为违法解除劳动合同。
后续行动建议：如果您作为公司方，面临员工违纪被查的情况，建议先审查公司规章制度中关于违纪行为的规定，并收集充分的证据证明员工的违纪行为。如果您作为员工方，认为公司的辞退行为违法或不合理，可以咨询专业律师的意见，并考虑通过法律途径维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询。