如果海洋上的船涉嫌违法，员工被抓，员工首先应保持冷静，积极配合执法部门的调查，同时根据具体情况采取相应的法律措施维护自身权益。以下从不同角度为你详细分析：
从员工自身权益保护角度
- 了解被抓原因
- 员工有权要求执法部门明确告知被抓的具体原因和涉嫌的违法事项。例如，是涉嫌走私、非法捕捞还是其他违法行为。只有清楚了解原因，才能有针对性地进行后续应对。
- 如果执法部门没有给出合理的解释或存在程序上的问题，员工可以在适当的时机提出质疑和申诉。
- 配合调查但行使沉默权
- 在接受调查过程中，员工应积极配合执法人员的工作，如实回答与案件相关的问题。但同时也要清楚自己享有沉默权，对于可能涉及自证其罪的问题，有权保持沉默，避免因不当陈述给自己带来不利后果。
- 比如，在未明确自身法律责任和证据情况时，不要轻易承认自己参与违法活动，以免后续难以辩解。
- 及时联系家属并委托律师
- 员工被抓后，应尽快通过合法途径联系家属，告知自己的情况。家属可以为其提供生活上的支持和精神上的鼓励。
- 同时，员工或家属应尽快委托专业的律师介入。律师可以根据案件情况，为员工提供法律咨询、代理申诉、申请取保候审等法律服务，维护员工的合法权益。例如，律师可以审查执法部门的程序是否合法，证据是否充分，为员工制定合理的辩护策略。
从法律责任认定角度
- 区分个人责任与单位责任
- 如果船上的违法行为是单位组织或授意的，员工可能只是执行工作任务，此时应区分个人责任和单位责任。员工需要证明自己的行为是在单位的指挥和安排下进行的，自身并没有主观故意违法。
- 例如，在非法捕捞案件中，如果员工只是按照船长的指示进行捕捞作业，对捕捞的种类和数量并不知情，且没有从中获取额外的非法利益，那么其法律责任可能会相对较轻。
- 证明自身无过错或过错较小
- 员工可以通过提供相关证据来证明自己在违法行为中不存在过错或过错较小。比如，工作记录、同事证言等，证明自己曾对违法行为提出过异议或拒绝参与，但由于种种原因未能阻止。
- 如果员工能够证明自己是被胁迫参与违法活动的，根据法律规定，可能会减轻或免除其法律责任。例如，船长以威胁员工及其家人的生命安全为由，强迫员工参与走私活动，员工在这种情况下参与违法，可向执法部门说明情况，争取从轻处理。
从后续处理角度
- 关注案件进展
- 员工或其家属应密切关注案件的进展情况，及时了解执法部门的调查结果和检察机关的起诉意见。可以通过律师与办案机关进行沟通，获取相关信息。
- 如果对案件的处理结果有异议，可以在法定期限内提出申诉或上诉。例如，如果员工认为法院的判决不公正，可以在判决生效前向上级法院提起上诉，维护自己的合法权益。
- 接受教育和改造
- 如果员工最终被认定有违法行为并受到处罚，应认真接受教育和改造，树立正确的法律意识。在服刑期间，遵守监规纪律，积极参加学习和劳动，争取早日回归社会。
- 出狱后，要吸取教训，遵守法律法规，避免再次陷入违法犯罪的境地。