结论：缺卡扣绩效分是否合理，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及扣减绩效分的合法性与合理性等因素。

分析：

1. 公司规章制度与劳动合同约定：

   • 首先，需要查看公司的规章制度以及员工与公司签订的劳动合同中，是否有关于缺卡与绩效分扣减的明确规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了缺卡将扣减绩效分，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣减绩效分的行为可能是合理的。
   • 反之，如果规章制度或劳动合同中没有相关规定，或者规定模糊不清，那么公司单方面扣减绩效分可能缺乏合法依据。

2. 扣减绩效分的合法性与合理性：

   • 合法性方面，公司扣减绩效分必须遵守国家法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。例如，扣减绩效分不能导致员工工资低于当地最低工资标准，否则将构成违法行为。
   • 合理性方面，公司扣减绩效分应当与员工的缺卡行为具有直接的关联性，且扣减的幅度应当合理。如果扣减的绩效分过多，或者与缺卡行为无直接关联，那么可能被视为不合理。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 公司在实施扣减绩效分时，应当确保程序的公正性和透明性。例如，应当及时通知员工扣减的原因和依据，允许员工进行申诉和解释。
   • 员工在面对公司扣减绩效分时，也有权要求公司出示相关的规章制度和劳动合同条款，以了解自己的权益和义务。

建议：

• 对于公司而言，应当制定明确、合理的规章制度和劳动合同条款，明确缺卡与绩效分扣减的关系，并在实施时确保程序的公正性和透明性。
• 对于员工而言，如果认为公司扣减绩效分的行为不合理或违法，可以与公司进行沟通协商，或者向劳动监察部门投诉举报，以维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司扣减绩效分的行为被认定为不合理或违法，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。
• 员工也可能因此与公司产生劳动争议，需要通过劳动仲裁或诉讼等途径解决。

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