不定时工作制条款无效的后果主要包括以下几个方面：
加班费支付义务：
- 核心要点：若不定时工作制条款被认定为无效，用人单位与劳动者之间关于不定时工作制的约定将不再具有法律效力。这意味着，劳动者的工作时间将恢复为标准工时制，即每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。在此情况下，若劳动者实际工作时间超过上述标准，用人单位需按照法律规定支付加班费。
- 法律依据：根据《劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
劳动争议风险增加：
- 核心要点：不定时工作制条款无效后，劳动者与用人单位之间可能因工作时间、加班费支付等问题产生争议。这些争议若无法通过协商解决，可能引发劳动仲裁或诉讼，增加双方的法律成本和时间成本。
- 建议措施：为避免劳动争议，用人单位应确保与劳动者签订的劳动合同中关于工作时间的条款合法有效，并严格按照法律规定执行。同时，劳动者也应了解自己的权益，如发现用人单位存在违法行为，可及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
行政处罚风险：
- 核心要点：若用人单位未经批准擅自实行不定时工作制，或实行不定时工作制但未按照规定支付加班费，可能面临劳动行政部门的处罚。处罚措施可能包括警告、罚款等，具体根据违法情节的严重程度而定。
- 法律依据：根据《劳动保障监察条例》的相关规定，用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。
对劳动者健康的影响及补偿：
- 核心要点：长期超时工作可能对劳动者的身心健康造成损害。若不定时工作制条款无效导致劳动者超时工作，且因此造成健康损害的，劳动者有权要求用人单位承担相应的赔偿责任。
- 建议措施：劳动者应关注自己的身体健康状况，如发现因超时工作导致身体不适，应及时就医并保留相关证据。同时，可与用人单位协商赔偿事宜，或通过法律途径维护自己的合法权益。
总结与建议：不定时工作制条款无效将带来一系列法律后果，包括加班费支付义务、劳动争议风险增加、行政处罚风险以及对劳动者健康的影响及补偿等。为避免这些后果，用人单位应确保与劳动者签订的劳动合同合法有效，并严格按照法律规定执行工作时间和加班费支付等制度。劳动者也应了解自己的权益，积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。