当面对工程项目已经验收但尚未结算的情况时，作为施工方，您可以按照以下步骤来处理，以确保自身合法权益得到保障：

一、明确未结算的具体原因

首先，您需要详细分析并明确未结算的具体原因。这可能包括合同条款不明确、双方对工程量或质量存在争议、发包方拖延支付等多种情况。明确原因是后续采取措施的基础，有助于您更有针对性地解决问题。

二、收集全面且充分的证据

1. 合同文件：仔细研究工程承包合同及其补充协议，明确双方关于工程价款计算方式、结算时间、付款条件等核心约定。
2. 施工资料：收集施工图纸、施工日志、工程变更通知及技术核定单等资料，这些对于确定实际完成的工程量至关重要。
3. 往来函件与沟通记录：保存涉及工程进度、质量、价款等方面的函件及会议记录，这些记录反映了双方的沟通过程及可能的确认信息。
4. 工程进度报告与验收报告：详细记录工程各阶段的完成情况，并附上验收报告，作为计算已完工程价值的重要依据。
5. 付款记录：准确记录建设单位已支付的工程款金额、时间及支付方式，便于核对结算。

三、积极与建设单位沟通协商

1. 组建专业团队：由项目经理、造价师等相关人员组成沟通团队，明确职责分工，确保沟通的专业性和有效性。
2. 制定沟通计划：安排与建设单位的沟通时间、地点及方式，提前准备讨论议题及所需资料，确保沟通的有序进行。
3. 友好协商：主动提出结算要求，阐述结算依据及理由，争取双方达成一致意见。若涉及工程变更，需详细说明变更原因、内容及造价影响，共同核对变更工程量及价款。

四、启动并跟进结算程序

1. 提交结算报告：根据收集的资料编制工程结算报告，内容应完整、数据准确，并按合同约定时间及方式提交给建设单位。
2. 督促审核进度：及时跟进建设单位的审核情况，提醒其在约定期限内完成审核。对建设单位提出的疑问或异议，积极配合解答及协商，确保结算工作的顺利进行。

五、妥善解决争议

1. 第三方造价鉴定：若双方对结算金额存在争议，可共同选定有资质的造价咨询机构进行客观评估鉴定，以确定合理的结算金额。
2. 申请调解：向行业主管部门、行业协会或专业调解机构申请调解，寻求和解方案。调解机构的专业性和中立性有助于双方达成公平合理的解决方案。
3. 法律手段：若协商及调解均无果，可根据合同中的仲裁条款或向有管辖权的人民法院提起仲裁或诉讼。在此过程中，务必充分准备证据，聘请专业律师以维护自身合法权益。

六、预防未来纠纷

为避免类似问题再次发生，建议您在签订工程合同时即明确约定结算方式、时间以及争议解决方式和程序。同时，加强合同管理，确保双方权益得到充分保障。在合同履行过程中，保持与建设单位的良好沟通，及时解决可能出现的问题，减少未来纠纷的发生。

综上所述，处理未结算的工程需要综合运用法律知识和实践经验，通过明确原因、收集证据、积极沟通、启动程序及妥善解决争议等步骤，以高效、合法的方式推动问题解决。同时，注重预防措施以减少未来纠纷的发生，确保工程项目的顺利进行和双方权益的得到保障。