施工单位未签字的罚款单是否有效，需分情况讨论，具体如下：

1. 若罚款单基于合法有效的合同条款或法律规定作出
   若建设单位与施工单位签订的合同中明确约定了“施工单位违反特定条款时，建设单位有权单方开具罚款单并直接扣除款项”，且该条款不违反法律强制性规定（如《民法典》中关于格式条款、违约金调整等规则），则即使施工单位未签字，罚款单仍可能因合同依据充分而被认定为有效。但需注意：

   • 建设单位需证明施工单位确实存在违约行为（如通过监理报告、现场照片、验收记录等证据）；
     
   • 罚款金额需合理，不得超过合同约定或实际损失的30%（参考《民法典》第585条关于违约金过高的调整规则）。

2. 若罚款单缺乏合同或法律依据，仅凭单方主张作出
   若建设单位无法证明罚款的合同依据或法律依据（如合同未约定罚款条款，或施工单位行为不构成违约），则罚款单可能因“无权处罚”被认定为无效。此时：

   • 施工单位有权拒绝签字，并可通过书面函件明确反对；
     
   • 若建设单位强行扣款，施工单位可要求返还，并可主张建设单位承担违约责任（如逾期付款利息）。

3. 特殊情形：行政处罚类罚款单
   若罚款单由行政机关（如住建部门、安全监督机构）作出，则施工单位是否签字不影响罚款单的效力。根据《行政处罚法》，行政处罚决定自送达时生效，施工单位需在法定期限内履行（如缴纳罚款），否则可能面临加处罚款或强制执行。此时：

   • 施工单位若对罚款有异议，应通过行政复议或行政诉讼途径解决，而非拒绝签字；
     
   • 拒绝签字可能被视为“拒收”，行政机关可通过留置送达、公告送达等方式完成送达程序。

建议：

• 对建设单位：开具罚款单前需确保合同依据充分、证据完整，避免因程序瑕疵导致罚款无效；
  
• 对施工单位：收到罚款单后应首先核查依据，若认为不合理可书面提出异议，必要时通过法律途径维权。
  

如有具体合同条款或罚款单内容，可进一步分析细节。