针对您提出的“和A公司签合同但由B公司交社保是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动法和社保法规的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、合法性判断
该做法的合法性并非绝对，而是取决于多种因素的综合考量。在特定条件下，如A公司与B公司之间存在合法的委托代缴协议、符合相关法律法规和政策规定，并且您作为劳动者已明确同意时，这种做法可能是合法的。然而，在大多数情况下，若缺乏明确的法律关系或合作协议，或违反当地法律法规，则该做法可能非法，存在损害您权益和法律风险的可能。
二、合法性的具体条件
委托关系合规：
- A公司若因管理需要，与具备相应资质和能力的B公司签订了正规的委托代缴协议，且该协议符合法律法规和政策规定，这种委托关系在形式上是可行的。但需注意，委托代缴并不改变社保和公积金的缴纳主体责任，A公司仍需承担最终责任。
劳动者知情同意：
- A公司在签订劳动合同时或实际操作中，应向您明确说明社保和公积金将由B公司代缴，并获得您的书面同意。这是保障您知情权的重要环节，也有助于减少法律风险。
关联公司或劳务派遣等合作关系：
- 如果A公司和B公司是关联公司，或存在劳务派遣等合法的合作关系，并且这种操作符合当地法律法规的规定，那么这种做法也可能是合法的。但需确保这种合作关系真实存在，且符合相关法律法规。
三、存在的违法风险
损害劳动者权益：
- 代缴可能导致您在享受购房、落户、子女上学等政策时遇到障碍。若B公司管理不善或资金问题导致社保和公积金未能按时足额缴纳，将直接影响您的社保待遇和公积金使用。
违反劳动和社保法规：
- 社保和公积金的缴纳主体应与劳动关系主体一致。若A公司将缴纳义务委托给B公司而无合理依据和规范操作，可能被视为未履行法定缴纳义务，存在违反劳动法律法规的嫌疑。相关部门可能责令A公司改正，并处以罚款等行政处罚。
四、劳动者应对措施
若您遇到这种情况且自身权益受到损害，建议采取以下措施：
与A公司协商：
- 首先尝试与A公司沟通，了解代缴的具体原因和情况，并表达您的关切和诉求。
向相关部门投诉：
- 若协商无果，您可向劳动监察部门、社保部门或公积金管理中心投诉，寻求官方帮助和解决方案。
法律途径：
- 在必要时，您可通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
五、总结与建议
综上所述，和A公司签合同但由B公司交社保的合法性取决于多种因素。作为劳动者，您应了解清楚相关情况，并咨询专业的法律人士或劳动监察部门，以确保自己的权益得到妥善保护。同时，我也建议用人单位遵守相关法律法规，确保社保和公积金的缴纳符合规定，避免潜在的法律风险。