结论前置：怀孕员工刚怀孕就不来上班的工资发放问题，需根据具体情况来处理。若员工正常出勤，工资应正常发放；若请病假、保胎假或产假，工资按相关规定支付；若旷工，则可不支付工资并依规处理。以下是对各种情况的详细分析：

1. 正常出勤情况：

   • 如果怀孕员工在怀孕期间仍然正常出勤工作，那么她的工资必须按照正常工资标准发放。这是基于保障女性员工孕期权益的基本法律要求，公司不得因员工怀孕而降低或变相降低其工资待遇。

2. 病假或保胎假情况：

   • 提供有效证明：若员工因怀孕身体不适需要休假，并提供了正规医疗机构出具的病假或保胎假证明，公司应当按照病假工资标准支付工资。病假工资通常不得低于当地最低工资标准的一定比例（如80%），具体比例根据各地规定可能有所不同。例如，如果当地最低工资标准是2000元/月，那么病假工资至少应为1600元/月（假设比例为80%）。
   • 未提供有效证明：若员工声称是病假但未及时提供有效证明，公司可以先按事假处理不支付工资；待员工后续补充有效证明后，再按照病假工资标准补发相应期间的工资。

3. 产假期间情况：

   • 已缴纳生育保险：如果公司已为员工缴纳生育保险，那么产假期间的生育津贴将由生育保险基金支付。支付标准通常为本单位上年度职工月平均工资。例如，如果公司上年度职工月平均工资是5000元，那么员工产假期间的生育津贴就是5000元/月。
   • 未缴纳生育保险：如果公司未为员工缴纳生育保险，那么产假期间的工资应由公司按照女职工产假前的工资标准支付。

4. 旷工情况：

   • 如果员工既没有请假也没有合理的解释就不来上班，这种情况属于旷工。公司有权依据经合法程序制定并公示的规章制度对旷工行为进行处理，通常旷工期间是不支付工资的。若旷工达到一定天数严重违反公司规章制度，公司还有权解除劳动合同且无需支付经济补偿，但前提是公司的规章制度合法有效且有证据证明已向员工公示告知。

5. 特殊情况处理：

   • 对于因特殊原因（如严重妊娠反应、并发症等）无法工作的怀孕员工，若公司同意其休假，双方应就工资发放问题达成一致意见并签订书面协议。在此情况下，公司可以根据员工的实际情况和公司的政策决定是否发放工资以及发放的标准。

建议措施：

• 公司应与怀孕员工保持密切沟通，了解其具体情况和需求，以便做出合理的安排。
• 公司应确保严格遵守相关法律法规，保障怀孕员工的合法权益。
• 在处理此类问题时，公司应以书面形式与员工沟通并保留好相关证据，以避免后续可能出现的劳动纠纷。
• 如果双方对工资发放问题存在争议，建议通过协商或法律途径解决，以维护双方的合法权益。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。