结论前置：员工因不能胜任工作被开除时，企业一般需要支付经济补偿，但必须遵循法定的程序和条件。若企业未按规定操作，则可能面临支付双倍赔偿金的风险。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，特别是第四十条和第四十六条，明确指出了劳动者因不能胜任工作且经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任的，用人单位在提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同，并需向劳动者支付经济补偿。
二、经济补偿的计算与支付
计算标准：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限来计算，具体为每满一年支付一个月工资的标准。
- 对于六个月以上不满一年的情况，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。
- 这里的“月工资”指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
最高限额：
- 如果劳动者的月工资高于所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
计算公式：
- 经济补偿 = 工作年限 × 月工资（或职工月平均工资三倍，以较低者为准，且不超过十二年）
- 其中，月工资 = 劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资
三、用人单位需履行的法定程序
认定不能胜任工作：
- 用人单位必须依据明确、合理的考核标准和证据来认定劳动者不能胜任工作，如岗位说明书、绩效考核制度等，并保留相关书面材料。
培训与调岗：
- 在确认劳动者不能胜任工作后，用人单位应先进行培训或调整工作岗位，且这些措施应具有合理性和针对性。
再次评估：
- 培训或调岗后，用人单位需对劳动者进行再次评估，以确定其是否能胜任新岗位或改进后的工作。
通知与代通知金：
- 若劳动者仍不能胜任工作，用人单位应提前三十日以书面形式通知劳动者或额外支付一个月工资作为代通知金，然后才能解除劳动合同。
四、特殊情况：无需支付经济补偿的情形
如果劳动者存在严重违反规章制度、严重失职、营私舞弊等给用人单位造成重大损害等法定过错情形，即使其不能胜任工作，用人单位也可以依法解除劳动合同且无需支付经济补偿。
五、违法解除的后果
若用人单位未按照上述法定程序操作，如未进行培训或调岗就直接辞退劳动者，则属于违法解除劳动合同。在这种情况下，用人单位需要依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
实际操作建议
- 保留证据：用人单位在认定劳动者不能胜任工作时，应确保有充分的书面证据支持，如绩效考核记录、培训记录等。
- 合法程序：用人单位在解除劳动合同前，应确保已履行所有法定程序，包括培训、调岗、再次评估、通知等。
- 及时咨询：对于复杂的劳动纠纷，建议用人单位及时咨询专业律师，以确保操作合法合规，避免不必要的法律风险。
作为劳动者，如果您因不能胜任工作被开除，且用人单位未按照法定程序操作或未支付经济补偿，您可以依法维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。