合同只盖合同专用章没有法人签字，在大多数情况下是有效的，但具体效力需根据合同内容、法律规定及实际情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合同有效的情况
合同专用章的法定效力：
- 合同专用章是公司专门用于签订合同的印章，具有代表公司签订合同的法定效力。根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。因此，合同上加盖合同专用章，即使没有法人签字，也通常视为公司对合同内容的认可和承诺，合同依法成立并生效。
符合交易习惯或授权：
- 在商业实践中，如果双方根据交易习惯或以往合作模式，认可仅加盖合同专用章即可使合同生效，那么此类合同有效。
- 若公司内部有明确规定，授权特定人员使用合同专用章签订合同，则此类合同同样有效，无需法人额外签字。
履行治愈规则：
- 在签名、盖章或按指印之前，如一方已履行主要义务且对方接受，该合同也被视为已成立。即实际履行可以弥补形式上的不足，使得合同生效。
合同可能无效或效力待定的情况
合同专用章被伪造或盗用：
- 如果合同专用章被他人伪造或盗用后加盖在合同上，且公司对此并不知情且未追认，则该合同可能无效。因为此时的盖章行为并非公司的真实意思表示。
存在法定无效事由：
- 合同内容若违反法律法规的强制性规定，或存在恶意串通、损害国家、集体或第三人利益等法定无效情形，即使加盖了合同专用章，合同也可能无效。
合同约定特别生效条件：
- 当事人在合同中特别约定了合同必须在签字并加盖合同专用章后才生效的情况下，仅有合同专用章而没有法人签名的合同可能不会生效。这是尊重当事人意思自治的体现，此时合同效力待定，需满足双方约定的生效条件后方可生效。
法律建议
明确合同生效条件：
- 为避免不必要的纠纷，建议在签订合同时明确约定合同的生效条件，如是否需要法人签字、盖章的具体要求等。
加强公章管理：
- 公司在管理合同专用章时应加强内部控制，防止公章被滥用或盗用。可以建立严格的公章使用审批制度，确保每次使用都有明确的记录和审批流程。
审查合同内容：
- 在签订合同前，应仔细审查合同内容，确保合同内容合法合规，且符合双方的真实意思表示。如有疑问或不确定之处，应及时咨询专业法律人士。
保留相关证据：
- 在合同签订和履行过程中，应保留好相关证据，如合同文本、履行凭证、沟通记录等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
综上所述，合同只盖合同专用章没有法人签字在一般情况下是有效的，但具体效力还需结合合同的具体内容、当事人的约定以及法律法规的规定来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。