劳动关系不明确时，一般不能直接提起行政诉讼，但可以通过劳动仲裁、民事诉讼等途径确认劳动关系后，再视情况决定是否需要行政诉讼。以下是详细分析：

1. 劳动关系确认的常规途径
   根据《劳动争议调解仲裁法》第二条，劳动关系确认属于劳动争议范畴，应先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁裁决后，若对结果不服，可向法院提起民事诉讼（《劳动法》第八十三条）。这是确认劳动关系最直接的途径，行政诉讼并非首选。

2. 行政诉讼的适用场景
   行政诉讼通常针对行政机关的具体行政行为（如工伤认定、社保缴纳等）。若劳动关系不明确导致行政机关拒绝受理相关申请（如工伤认定），可先通过劳动仲裁或民事诉讼确认劳动关系，再对行政机关的拒绝行为提起行政诉讼。例如：

   • 员工申请工伤认定，但人社局以“劳动关系不明确”为由拒绝，此时需先通过仲裁/诉讼确认劳动关系，再就拒绝行为提起行政诉讼。
     
   • 若行政机关在劳动关系确认过程中存在程序违法（如超期不作为），可直接提起行政诉讼要求履行职责。

3. 特殊情况下的直接行政诉讼
   若行政机关已作出涉及劳动关系的行政行为（如错误注销用工备案），且该行为直接影响权利义务，可直接提起行政诉讼要求撤销或变更。但需注意：此类诉讼仍需以“行政行为违法”为前提，而非单纯因“劳动关系不明确”。

行动建议：

1. 优先申请劳动仲裁，提交劳动合同、工资记录、考勤证据等证明劳动关系；
   
2. 若仲裁败诉或未获受理，15日内向法院起诉，可申请法院调查取证；
   
3. 若涉及行政机关拒绝受理或错误行政行为，在确认劳动关系后，针对具体行政行为提起行政诉讼；
   
4. 诉讼过程中注意3年诉讼时效（从知道权利被侵害之日起算）。

劳动关系纠纷通常需“先仲裁后诉讼”，行政诉讼仅作为后续救济手段。若需进一步分析具体证据或诉讼策略，可随时向我咨询。