员工要请三个月的假是否合法，需根据具体情况综合判断，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、法定假期角度
病假：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤需要停止工作进行治疗和休息的，享有一定期限的医疗期。医疗期的具体时长根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，最长可达二十四个月。因此，如果员工因病需要请假三个月，且符合医疗期的规定，那么这种请假是合法的。病假期间，工资的发放标准各地可能有所不同，但一般会按照当地最低工资标准的一定比例发放。
产假、陪产假、护理假等法定假期：
- 如果员工符合享受这些法定假期的条件，且假期时长达到或超过三个月（如女职工生育可享受不少于98天的产假），那么员工有权请假，且这种请假是合法的。用人单位需按照法律规定保障员工在这些假期期间的工资待遇等权益。
带薪年休假、调休假等：
- 这些假期通常时长较短，不太可能直接请三个月。但在特殊情况下，如果通过统筹安排可能拼凑出较长的连续休假时间接近三个月，且符合用人单位的规章制度和劳动合同约定，那么这种请假也可能是合法的。不过，这种情况较为少见，且需要用人单位的同意。
二、用人单位规章制度和员工协商角度
事假：
- 事假主要由员工个人因私事提出申请，是否批准由用人单位根据自身生产经营状况和规章制度决定。连续请三个月事假对工作安排影响较大，因此用人单位可能不易批准。但在特殊且合理的情况下（如家人患重病需长期照顾），并提前与用人单位充分沟通协商后，有可能获得批准。如果用人单位同意员工的请假申请，并给予了相应的待遇（如事假工资），则该请假行为是合法的。
单位特殊规定：
- 用人单位在不违反法律法规的前提下，有权制定关于请假的内部规章制度。这些规章制度可能包括请假的最长时长、请假审批程序等。员工应当遵守单位的规章制度，若未经特殊批准而擅自请假三个月，将不符合单位规定，可能面临相应的纪律处分。
三、综合建议
对于员工而言：
- 在请假前，应充分了解自身享有的法定假期情况，以及用人单位的规章制度和劳动合同约定。
- 如果需要请假三个月，应提前与用人单位进行充分沟通协商，说明请假的原因和期限，并尽量提供相关的证明材料（如医疗证明、家庭情况说明等）。
- 如果用人单位不同意请假申请，应尊重用人单位的决定，并考虑其他解决方案（如调整工作时间、寻求家人帮助等）。
对于用人单位而言：
- 应建立健全的请假管理制度，明确请假的条件和程序，以及不同类型假期的工资待遇等。
- 在处理员工的请假申请时，应充分考虑员工的实际情况和合理需求，尽量给予理解和支持。
- 如果无法批准员工的请假申请，应向员工说明原因，并协商其他解决方案。
总之，员工要请三个月的假是否合法，需根据具体情况综合判断。在处理这类问题时，建议员工和用人单位都保持理性和沟通，共同寻求合理的解决方案。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。