结论概述：
- 员工微信通知离职，公司不同意，员工旷工是否需赔偿公司损失，取决于员工旷工行为是否给公司造成实际损失及损失大小，同时需考虑员工离职的合法性及程序问题。
- 若员工旷工行为违反公司规章制度或劳动合同约定，且给公司造成实际损失，员工可能需要承担赔偿责任。
详细分析：
一、员工离职的合法性及程序
员工离职通常需遵循一定的程序，包括提前通知公司、办理离职手续等。若员工仅通过微信通知离职而未按照公司规定或劳动合同约定的程序进行，可能构成违法解除劳动合同。然而，这并不直接决定员工是否需要赔偿公司损失，而是作为判断员工行为性质的一个因素。
二、旷工行为的法律后果
旷工是指员工未经批准擅自缺勤的行为。若员工在离职过程中旷工，且该行为违反了公司的规章制度或劳动合同的约定，公司有权根据相关规定对员工进行处理，包括扣除工资、解除劳动合同等。但旷工行为本身并不直接导致员工需要赔偿公司损失，除非该行为给公司造成了实际的经济损失。
三、赔偿公司损失的条件
员工是否需要赔偿公司损失，需满足以下条件：
- 员工旷工行为给公司造成实际损失：这包括但不限于因员工旷工导致的生产停滞、客户流失、额外招聘和培训成本等。公司需提供充分证据证明损失的存在及大小。
- 员工旷工行为与损失之间存在因果关系：即公司的损失是由于员工的旷工行为直接导致的，而非其他因素。
- 员工存在过错：员工明知旷工会给公司造成损失，仍故意或过失地实施旷工行为。
四、具体案例及法律适用
在实际操作中，法院会综合考虑员工旷工的时长、公司的规章制度、劳动合同的约定、公司实际遭受的损失以及员工的主观过错等因素，来判断员工是否需要赔偿公司损失。例如，若员工仅旷工一天，且未给公司造成明显损失，法院可能不会支持公司的赔偿请求。反之，若员工旷工多日，导致公司生产线停滞、客户流失等严重后果，且员工存在明显过错，法院则可能判决员工承担部分或全部赔偿责任。
五、建议
- 对于员工：在离职过程中，应遵循公司规定和劳动合同约定的程序，避免擅自旷工。若与公司存在争议，应通过合法途径解决，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
- 对于公司：应建立健全的规章制度和劳动合同条款，明确员工离职的程序和旷工的法律后果。在员工旷工时，应及时采取措施减少损失，并保留相关证据以便后续维权。
六、法律依据
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条：劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第九十条：劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
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