若发现执行依据存在问题，可通过以下途径处理，具体需结合问题类型和阶段选择合适方案：

1. 执行异议程序（针对执行行为或标的的异议）
   若认为执行依据（如判决书、调解书）本身无误，但执行法院在执行过程中存在程序违法（如超标的查封、错误执行第三人财产），或对执行标的权属有争议，可在执行过程中向执行法院提出书面执行异议（《民事诉讼法》第232条）。法院需在15日内审查并作出裁定，对裁定不服可申请复议或提起执行异议之诉。

2. 申请再审（针对执行依据实体错误）
   若执行依据（如判决书）存在事实认定错误、法律适用错误或程序违法（如审判人员受贿、证据系伪造），可在判决生效后6个月内向上一级法院申请再审（《民事诉讼法》第207条）。再审期间原则上不停止执行，但可提供担保申请中止执行。若再审改判或撤销原判决，执行依据自动失效。

3. 第三人撤销之诉（针对损害第三人利益的判决）
   若未参与诉讼的第三人认为执行依据（如判决书）损害其合法权益（如财产被错误判归他人），可在知道权益受损之日起6个月内向作出判决的法院提起第三人撤销之诉（《民事诉讼法》第59条）。法院经审理撤销原判决的，执行依据失效。

4. 检察监督（针对严重违法判决）
   若认为执行依据存在审判人员贪污受贿、徇私舞弊、枉法裁判等情形，可向检察院申请民事检察监督（《民事诉讼法》第215条）。检察院经审查可提出检察建议或抗诉，启动再审程序。

5. 执行和解或协商（针对执行依据部分瑕疵）
   若执行依据存在非原则性瑕疵（如利息计算错误、履行期限表述模糊），可与对方协商达成执行和解协议，经法院确认后终止原执行程序。和解协议具有强制执行力，但需注意避免损害第三方利益。

关键提醒：

• 执行依据问题需在执行程序终结前提出，逾期可能丧失救济权利；
  
• 不同程序需提交不同材料（如再审需提交新证据、第三人撤销之诉需证明原判决损害其利益）；
  
• 建议优先通过书面形式提出申请，并留存送达凭证，避免口头申请导致程序瑕疵。
  

若需进一步分析具体案件中的执行依据问题，可提供判决书、执行裁定等材料，我将结合案情为您详细解答。