结论前置：
- 一般情况下，事故认定书两年后仍然可以起诉，但需注意诉讼时效的限制，通常为三年，自权利人知道或应当知道权利受损及义务人之日起计算。
- 若存在特殊情况，如诉讼时效中断或中止，起诉时间可能会相应延长。
详细分析：
一、诉讼时效的一般规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于交通事故中，当事人因赔偿等问题需要起诉的情况。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，在事故认定书下发后两年，只要未超过三年（且未超过二十年最长保护期），当事人仍然可以起诉。
二、诉讼时效的特殊情况
诉讼时效中断：
- 根据《民法典》第一百九十五条，若权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或者申请仲裁等，诉讼时效中断，从中断时起，诉讼时效期间重新计算。
- 举例：如果事故发生后两年内，受害者曾向肇事方主张赔偿，即构成诉讼时效中断，诉讼时效期间将重新计算三年。
诉讼时效中止：
- 根据《民法典》第一百九十四条，在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力、无民事行为能力人或限制民事行为能力人没有法定代理人等障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
- 举例：如果事故后受害者因重伤无法行动，导致无法提起诉讼，可视为诉讼时效中止。待受害者恢复行动能力后，诉讼时效将继续计算。
三、起诉时的注意事项
证据收集：
- 随着时间的推移，证据的收集和保存可能变得更加困难。事故现场变化、证人记忆模糊、监控录像被覆盖等都可能影响案件的证明。
- 建议：当事人应尽快收集并妥善保存相关证据，包括现场照片、证人证言、医疗记录、维修费用清单等，以备后续起诉之需。
法律程序：
- 若对交通事故认定书的结果有异议，当事人应在收到认定书之日起三日内向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请。
- 复核处理：上一级公安机关交通管理部门将在受理复核申请后三十日内进行审查，并作出复核结论。
- 行政诉讼：若对复核结果仍然不服，当事人可以在收到复核结论之日起十五日内向法院提起行政诉讼。逾期未提起诉讼的，交通事故认定书即发生法律效力。
四、实际建议
及时了解诉讼时效：
- 交通事故发生后，当事人应尽快了解法律规定的诉讼时效，避免因超过时效而导致权利无法得到保护。
积极协商赔偿：
- 为避免纠纷拖延，当事人应尽快与对方协商赔偿事宜。若协商无果，再考虑通过法律途径解决纠纷。
咨询专业律师：
- 如果你对诉讼时效、法律程序或证据收集等方面存在疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将为你提供准确的法律意见和帮助。
总结与建议：
事故认定书两年后仍然可以起诉，但需注意诉讼时效的限制以及可能存在的特殊情况。为避免证据灭失、责任人财产转移等不利情况，建议当事人在收到认定书后尽快评估自身权益，如有必要，及时采取法律行动。同时，保留好所有与事故相关的证据材料，以便在诉讼过程中使用。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。