在串通投标中，投标保证金被扣押是否合适，需根据具体情况及法律规定进行综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、法律对投标保证金的规定

投标保证金是投标人按照招标文件的要求向招标人出具的，以一定金额表示的投标责任担保。其目的在于保证投标人在递交投标文件后不得撤销投标文件，中标后无正当理由不得不与招标人订立合同，在签订合同时不得向招标人提出附加条件或者不按照招标文件要求提交履约保证金，否则，招标人有权不予返还其递交的投标保证金。

二、串通投标行为的法律性质

串通投标行为违反了《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，属于违法行为。串通投标不仅损害了招标人的利益，也破坏了公平竞争的市场环境。对于串通投标行为，法律有明确的处罚规定，包括罚款、没收违法所得、取消投标资格等。

三、投标保证金被扣押的合法性分析

1. 若投标保证金被扣押是基于合法程序：

   • 如果招标人在发现投标人存在串通投标行为后，按照招标文件的规定和法律程序，对投标保证金进行扣押，并作为对投标人违法行为的处罚或赔偿的一部分，那么这种扣押行为是合法的。
   • 在此情况下，投标人应当接受处罚，并承担相应的法律责任。

2. 若投标保证金被扣押缺乏合法依据：

   • 如果招标人未经合法程序，擅自扣押投标人的投标保证金，或者扣押的金额超过了法律规定的范围，那么这种扣押行为就是违法的。
   • 投标人有权要求招标人返还被扣押的投标保证金，并可以依法追究招标人的法律责任。

四、实际操作中的建议

1. 对于招标人：

   • 在发现投标人存在串通投标行为后，应当及时按照招标文件的规定和法律程序进行处理，包括扣押投标保证金等。
   • 在处理过程中，应当确保程序的合法性和公正性，避免侵犯投标人的合法权益。

2. 对于投标人：

   • 如果认为自己的投标保证金被非法扣押，应当及时收集证据，包括招标文件、投标文件、扣押通知等，以证明自己的权益受到侵害。
   • 可以向招标人提出异议，要求返还被扣押的投标保证金；如果招标人拒绝返还，可以向相关部门投诉或提起诉讼，维护自己的合法权益。

总结来说，在串通投标中，投标保证金被扣押是否合适，取决于扣押行为是否基于合法程序和法律规定。如果招标人按照法律程序和招标文件的规定进行扣押，那么这种行为是合法的；反之，则是违法的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。