结论：关于您签订的合同中的半薪协议，在您离职后能否要回相关权益，这主要取决于半薪协议的具体内容、签订背景以及是否违反了相关法律法规的强制性规定。以下是从不同角度进行的分析：
一、半薪协议的合法性分析
协议内容合法性：
- 如果半薪协议是双方真实意思的表示，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该协议在法律上是有效的。这意味着，如果您在离职时违反了协议中的某些条款（如未提前通知、违反竞业限制等），用人单位可能有权根据协议内容扣除部分工资或要求您承担其他责任。
- 然而，如果半薪协议的内容违反了法律法规的强制性规定，如低于当地最低工资标准、未支付加班费等，那么该协议中的相关条款是无效的。在这种情况下，您有权要求用人单位按照法律法规的规定支付您应得的工资和福利。
签订背景合法性：
- 半薪协议的签订背景也是判断其合法性的重要因素。如果协议是在您被胁迫、欺诈或重大误解的情况下签订的，那么该协议可能因缺乏真实意思表示而被认定为无效。
二、离职后能否要回相关权益
如果半薪协议合法有效：
- 如果半薪协议是合法有效的，且您在离职时没有违反协议中的任何条款，那么您通常无法直接要求用人单位支付被扣除的工资部分，因为这是双方约定的结果。
- 但是，如果您认为用人单位在执行半薪协议时存在不当行为（如无故扣除工资、未按照协议约定支付等），您可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位纠正不当行为并支付应得的工资。
如果半薪协议存在违法情形：
- 如果半薪协议的内容违反了法律法规的强制性规定，或者签订背景存在胁迫、欺诈等情形，那么您有权要求用人单位按照法律法规的规定支付您应得的工资和福利。
- 在这种情况下，您可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，并提供相关证据证明半薪协议的违法性或签订背景的不当性。劳动监察部门或劳动仲裁机构将依法进行调查和处理，并保障您的合法权益。
三、建议与行动
审查半薪协议：
- 首先，您需要仔细审查半薪协议的具体内容，包括工资支付方式、支付时间、支付条件等，以确定其是否合法有效。
收集证据：
- 如果您认为半薪协议存在违法情形或签订背景不当，您需要收集相关证据来支持您的主张。这些证据可能包括协议文本、工资条、银行转账记录、聊天记录等。
寻求法律帮助：
- 如果您在审查协议或收集证据过程中遇到困难，或者您不确定如何维护自己的合法权益，您可以向我咨询或寻求其他专业律师的帮助。我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
最后，我想强调的是，劳动法律关系复杂且多变，每个案件的具体情况都可能有所不同。因此，在处理类似问题时，建议您根据自身情况谨慎行事，并在必要时寻求专业法律帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。