关于“公司让员工开发票是否违法”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要依据交易的真实性和开票流程的合规性来综合判断。以下是我为您提供的详细分析：
一、合法开具发票的情况
基于真实交易背景：
- 当公司与员工之间，或员工代表公司与外部存在真实发生的应税行为，如销售商品、提供劳务等，员工可以依据实际业务情况，通过正规渠道（如税务机关）代开发票给公司或相关方。这是正常的商业交易流程，旨在保障税收的合法征收和经济的正常运行。
员工代表公司交易并开票：
- 在员工代表公司进行采购或接受服务的情况下，员工有责任确保交易的合规性，并获取合法的发票。公司要求员工在此类交易中开具发票，是符合法律规定的，也是公司财务管理和税务合规的必要环节。
二、可能构成违法的情况
虚开发票：
- 如果公司与员工之间，或员工代表公司与外部不存在真实的交易行为，却要求开具发票，或者开具的发票金额、内容与实际业务不符，这属于虚开发票的违法行为。虚开发票会扰乱税收征管秩序，损害国家税收利益，并可能面临罚款、有期徒刑等严厉的刑事处罚。
代开发票主体不符规定：
- 即使存在真实交易，但如果代开发票的主体不符合规定，如通过不正规的第三方“开票公司”代开，而非员工依法到税务机关代开，同样是违法的。这种途径往往伴随着税收违法行为和潜在的诈骗风险。
公司强制员工提供虚假发票：
- 如果公司强制员工提供与工作无关或虚假的发票，以此来规避法律义务或谋取不正当利益，这也是违法的。员工有权拒绝此类要求，并可向相关部门投诉或寻求法律援助。
三、员工在开票过程中的责任与注意事项
确保交易真实性：
- 员工在开具发票前，应仔细审查交易的真实性，确保发票内容与实际业务相符。虚假交易不仅可能导致法律纠纷，还会对个人和公司的信誉造成严重影响。
遵守税收法律法规：
- 在开具和接收发票时，员工应严格遵守税收法律法规的规定，如按照规定的时限、顺序、栏目一次性开具发票，并加盖发票专用章等。如有违反，可能会面临税务机关的处罚。
拒绝违法指令：
- 如果公司要求员工进行违法开票行为，员工有权拒绝，并可向相关部门反映情况，以保护自己的合法权益。
咨询专业意见：
- 对开票事宜有疑问时，员工应及时咨询专业的财务或税务人员，以避免法律风险。
四、公司管理建议
- 加强培训与管理：公司应加强对员工的相关培训和管理，确保员工了解开票流程和税收法规，提高员工的合规意识。
- 建立合规机制：公司应建立完善的开票合规机制，明确开票流程和责任分工，确保开票行为的合法性和规范性。
综上所述，公司让员工开发票是否违法，关键在于交易的真实性和开票流程的合规性。在正常的商业交易中，基于真实交易背景且开票流程合规的情况下，要求员工开具发票是合法的；但若涉及虚假交易或违规开票行为，则可能触犯法律。因此，无论是公司还是员工，在开具和接收发票时都应谨慎行事，确保所有交易和发票都是真实、合法的。