公司单方面停工是否合法，需根据具体情况和相关法律法规综合判断。以下从合法与非法两种情形进行详细分析：
合法停工的情形
协商一致停工：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括停工安排。
- 具体情形：若公司与员工经过平等、自愿的协商，就停工事宜达成一致，并明确停工期间的待遇，且以书面形式确定，如因业务调整需要临时停工，双方签订协议明确停工期间工资支付等，这种停工是合法的。
员工违纪等法定情形下的停工：
- 法律依据：依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者存在严重违反用人单位规章制度、严重失职等情形时，用人单位可以解除劳动合同，在解除前或调查期间，公司可依法对员工进行停工处理。
- 具体情形：例如员工多次旷工、严重违反公司安全规定等，公司可依据内部规章制度对员工进行停工，以进行调查或等待处理结果。
企业生产经营困难导致的停工：
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产的，在一个工资支付周期内，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资；超过一个工资支付周期的，若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理，如支付生活费。
- 具体情形：企业因市场需求下降、资金链断裂等客观原因无法提供正常工作岗位时，可实施停工，但需按法律规定支付工资或生活费。
劳动合同中有明确约定：
- 如果劳动合同中明确规定了停工的条件和程序，并且这些规定不违反法律法规，公司在符合条件时可依法让员工停工。
非法停工的情形
无正当理由且未经协商的停工：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十九条，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。
- 具体情形：公司无合理原因，未经与员工协商，擅自决定停工，侵犯了员工的劳动权利，属于违法行为。例如，公司因个人恩怨对某员工进行停工，而无任何合理依据。
以停工停岗变相裁员或逼迫辞职：
- 具体情形：公司通过停工停岗降低员工收入，迫使员工主动辞职，以避免支付经济补偿金，这种行为违法。员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
未支付相应待遇的停工：
- 具体情形：停工期间，公司未按法律规定和双方约定支付员工相应的待遇，如生活费等，也属于违法行为。员工有权要求公司补发待遇或采取其他法律措施。
员工权益保障措施
与公司协商解决：员工首先可尝试与公司协商，要求恢复工作或支付停工期间的工资损失。
向劳动监察部门投诉：协商无果时，员工可向当地劳动监察部门投诉，要求调查并处理公司的违法行为。
提起劳动仲裁或诉讼：若劳动监察部门未能解决问题，员工可提起劳动仲裁或诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结来说，公司单方面停工的合法性需根据具体情况和相关法律法规综合判断。在任何情况下，公司都应遵守法律法规和劳动合同规定，尊重员工权益，并与员工进行充分沟通和协商。员工在面临停工时，也应了解自己的权益和保障措施，及时采取适当行动维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。