股权激励公司通过发邮件的方式通知员工，在一般情况下是合法的。以下从多个角度进行详细分析：
合法性基础
合同形式与通知义务：
- 股权激励计划通常涉及公司与员工之间的合同关系。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同可以采取书面形式、口头形式或者其他形式。电子邮件作为一种书面形式的电子数据，具有法律效力，可以作为合同通知的有效方式。
- 公司有义务将股权激励计划的相关内容、条件、变更等及时通知员工。通过电子邮件通知，只要员工能够正常接收并阅读，即视为公司履行了通知义务。
公司内部规章制度：
- 如果公司内部规章制度中明确规定了股权激励计划的通知方式，且该方式包括电子邮件，那么公司通过电子邮件通知员工股权激励相关事宜是合法的。
- 即使公司内部规章制度没有明确规定通知方式，但电子邮件作为一种普遍接受的通讯方式，在双方没有异议的情况下，也可以作为有效的通知手段。
注意事项与风险防范
确保邮件内容准确无误：
- 公司在发送股权激励相关邮件时，应确保邮件内容准确无误，包括股权激励计划的条款、条件、授予时间、行权价格等关键信息。
- 邮件内容应清晰明了，避免使用模糊或容易引起歧义的表述。
保留邮件发送与接收记录：
- 公司应妥善保留股权激励相关邮件的发送与接收记录，以备将来可能出现的争议或纠纷时作为证据使用。
- 可以考虑使用专业的邮件管理系统或第三方服务来确保邮件的完整性和可追溯性。
员工确认与反馈：
- 在发送股权激励相关邮件后，公司可以要求员工进行确认或反馈，以确保员工已经收到并理解了邮件内容。
- 如果员工对邮件内容有疑问或异议，公司应及时进行解答和处理，以避免潜在的纠纷。
遵守相关法律法规：
- 公司在实施股权激励计划时，应遵守相关法律法规的规定，如《公司法》、《证券法》等。
- 特别是对于涉及上市公司或拟上市公司的股权激励计划，还需要遵守证券监管机构的相关规定和指引。
特殊情况下的合法性考量
- 如果股权激励计划涉及重大变更或影响员工切身利益的条款调整，公司除了通过电子邮件通知外，还应考虑采取其他更为正式和稳妥的通知方式，如书面通知、召开员工大会等，以确保员工充分知情并表达意见。
总结与建议：股权激励公司通过发邮件的方式通知员工在一般情况下是合法的，但公司应确保邮件内容准确无误、保留发送与接收记录、要求员工确认与反馈，并遵守相关法律法规的规定。如果你在股权激励计划的实施过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。