结论：当公司多发了工资且员工拒绝退还时，公司有权要求员工返还不当得利，并可通过多种合法途径解决此问题。以下是从不同角度的详细分析：
一、法律基础与员工义务
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百二十二条和第九百八十五条的规定，因他人没有法律根据取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。在此情境下，员工没有合法依据获得额外的工资，因此应当退还给公司。
员工义务：
- 员工在收到多发工资后，有义务核实工资数额，并在确认多发后主动与公司沟通退还。拒不退还可能构成民事侵权，甚至在某些情况下可能涉及刑事侵占罪（视金额和情节而定）。
二、处理方式与建议
协商与沟通：
- 内部沟通：公司应首先由财务部门或人力资源部门以友好、平和的态度与员工联系，明确指出工资多发的事实，并提供相应的工资计算明细、转账记录等作为证明，从道德和法律层面说明需要退还的理由。
- 书面通知：若口头沟通无效，公司可发出正式的书面通知，通过电子邮件、挂号信等方式送达员工，明确阐述多发工资的金额、时段、原因，并设定合理期限要求退还，同时告知可能的后续措施。
法律途径：
- 劳动争议调解：若员工仍拒绝退还，公司可向劳动争议调解组织申请调解，如企业劳动争议调解委员会或依法设立的基层人民调解组织，以寻求中立机构的协助来解决问题。
- 劳动仲裁：若调解无果，公司可向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，这是解决劳动争议的正式法律程序。
- 民事诉讼：若支付令不适用或执行受阻，公司可直接向人民法院提起民事诉讼，要求员工返还多发的工资，并提供充分证据支持其主张。法院将根据双方提供的证据进行审理，并作出判决。
- 申请支付令：公司可根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，向有管辖权的基层人民法院申请支付令，要求员工退还多发工资。若员工在规定期限内既不提出书面异议又不履行支付令，公司可申请强制执行。
从后续工资中扣除（需符合规定）：
- 若劳动合同或公司规章制度中有明确约定，并在员工同意或经过合法程序的情况下，公司可以从员工后续工资中扣除多发的部分。但应确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准，且每次扣除的比例一般不超过员工当月工资的20%。
寻求劳动保障行政部门的帮助：
- 公司还可向劳动保障行政部门举报或投诉，根据《劳动保障监察条例》第九条的规定，任何组织或个人对违反劳动保障法律、法规或规章的行为都有权举报。这将有助于公司维护合法权益，并促使员工退还多发工资。
三、预防措施与建议
- 加强财务管理：公司应加强财务管理和内部审计，确保工资发放的准确性和合规性。定期对工资发放流程进行审查和优化，减少人为错误和系统故障导致的多发工资情况。
- 提高员工法律意识：公司应定期对员工进行法律法规培训，提高员工的法律意识，使其了解不当得利的法律责任和后果。这有助于减少员工因误解或故意而拒不退还多发工资的情况。
总结：面对多发工资员工不退的情况，公司应综合运用法律手段、协商机制以及预防措施来解决问题。通过及时沟通、提供书面通知、寻求法律援助和完善内部管理等方式，确保双方的权益得到妥善处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。