若发现生态环境处罚立案时间存在错误，在诉讼中可采取以下处理方式：

1. 在行政诉讼中提出异议
   若对生态环境部门的处罚决定不服并提起行政诉讼，可在诉讼过程中明确指出立案时间错误这一事实，并要求法院审查该错误是否影响处罚决定的合法性。根据《行政诉讼法》相关规定，行政行为的程序合法性是法院审查的重点之一。若立案时间错误导致处罚程序违法（如超过法定追诉时效、未在法定期限内立案等），法院可能依法撤销或变更处罚决定。
   操作建议：

   • 收集证据证明立案时间错误（如行政机关的立案登记表、内部审批文件、送达回证等）；
     
   • 在起诉状或庭审中明确主张程序违法，并引用《行政处罚法》《环境行政处罚办法》中关于立案时限的规定（如一般需在发现违法行为后7个工作日内立案）；
     
   • 若立案时间错误导致处罚超过追诉时效（如《环境保护法》规定的“二年”或“五年”追诉期），可主张处罚决定无效。

2. 在复议阶段先行纠正
   若尚未提起诉讼，可先申请行政复议，要求复议机关纠正立案时间错误。根据《行政复议法》，复议机关需对行政行为的合法性、适当性进行全面审查，包括程序是否合法。若复议机关认定立案时间错误且影响处罚决定，可能直接撤销或变更处罚。
   操作建议：

   • 在复议申请中详细说明立案时间错误的具体情况及法律依据；
     
   • 提交证据证明实际立案时间与行政机关记录不符（如监控录像、证人证言等）；
     
   • 强调程序违法对处罚结果的影响（如剥夺了陈述申辩权、未及时调查取证等）。

3. 主张程序违法导致处罚无效
   若立案时间错误属于重大程序违法（如故意篡改时间、超期立案且无合理理由），可主张处罚决定因违反法定程序而无效。根据《行政诉讼法》第七十条，行政行为违反法定程序的，法院应判决撤销或部分撤销。
   操作建议：

   • 证明立案时间错误并非“技术性瑕疵”（如笔误），而是实质性影响程序公正；
     
   • 引用最高人民法院相关判例，说明程序违法与处罚结果之间的因果关系；
     
   • 若行政机关无法合理解释立案时间错误的原因，可进一步主张其存在主观过错。

注意事项：

• 立案时间错误的认定需以充分证据为基础，避免仅凭口头主张；
  
• 需区分“立案时间”与“处罚决定作出时间”，前者是程序起点，后者是结果形成时间，两者均可能影响合法性；
  
• 若立案时间错误未影响实体权利（如处罚幅度、事实认定），法院可能仅确认程序违法而不撤销处罚，此时可争取法院在判决中明确要求行政机关纠正程序瑕疵。

如有进一步证据或具体案情需要分析，可直接向我咨询，我会结合细节提供更精准的建议。