针对“公司不知道员工怀孕怎么赔偿”这一问题，核心在于明确公司是否需承担赔偿责任以及赔偿的具体情形，这主要取决于员工怀孕事实与公司解除劳动合同等行为之间的关联性及合法性。以下是具体分析：

1. 若公司解除劳动合同等行为合法，则无需赔偿

   • 情形说明：如果公司是在完全不知情员工怀孕的情况下，依据合法的规章制度和法定程序，因员工存在严重违反公司规定（如旷工、严重失职等）、不能胜任工作经培训或调岗后仍不能胜任、客观情况发生重大变化致使合同无法履行且双方未能就变更合同达成一致等法定情形，而解除与员工的劳动合同，那么公司的解除行为是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》相关规定，在这些法定情形下，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿，更不存在因员工怀孕而额外赔偿的问题。
   • 举例：员工小李经常无故旷工，严重违反了公司的考勤制度，公司在不知其怀孕的情况下，按照公司规定和法定程序解除了与小李的劳动合同，此时公司无需进行赔偿。

2. 若公司解除劳动合同等行为违法，则需赔偿

   • 情形说明：如果公司解除劳动合同的行为违反了法律规定，例如以员工怀孕为由直接解除合同，或者解除合同的理由不充分、程序不合法等，即使公司事先不知道员工怀孕，也可能构成违法解除。
   • 法律依据：依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。若违法解除，根据该法第四十八条，用人单位应当继续履行劳动合同；员工不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照本法第八十七条规定支付赔偿金，赔偿金的标准是经济补偿标准的二倍。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
   • 举例：员工小张怀孕后，公司以“公司经营调整，不需要该岗位”为由解除与小张的劳动合同，但公司无法提供充分的证据证明该调整的合理性和必要性，且未与小张协商变更劳动合同，此时公司的解除行为可能被认定为违法解除，需要向小张支付赔偿金。

3. 其他可能涉及的赔偿情况

   • 情形说明：除了违法解除劳动合同的赔偿外，如果公司在员工怀孕期间存在其他侵犯员工权益的行为，如未按照规定支付产假工资、未提供相应的生育保险待遇等，也可能需要承担相应的赔偿责任。
   • 法律依据：根据《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，女职工在孕期、产期、哺乳期享有相应的特殊保护和待遇，用人单位应当依法保障。若违反规定，用人单位可能需要补发工资、支付生育津贴差额等。
   • 举例：公司未按照规定为怀孕员工小王缴纳生育保险，导致小王在生育后无法享受生育津贴，那么公司可能需要按照小王应享受的生育津贴标准向其支付相应的费用。

建议：公司在处理与怀孕员工的相关事宜时，应当谨慎对待，充分了解相关法律法规，确保自身行为的合法性。如果对具体情况不确定，可以向专业的法律人士咨询。员工若遇到公司违法侵犯自身权益的情况，也可以进一步向我咨询具体的维权措施。