在合伙开店的情况下，股东（即合伙人）如果同时担任店内职务并参与日常管理，其工资的发放需要综合考虑多个方面，以确保既公平合理又符合法律法规要求。以下是一个详细且深入的解答：
一、工资性质与确定原则
工资性质：
- 合伙人参与店铺经营管理所取得的报酬，属于店铺的成本费用，而非利润分配。这是对合伙人劳动服务的支付对价，是店铺正常运营的必要开支。
确定原则：
- 基于岗位与职责：根据合伙人在店铺中担任的具体职务和承担的工作职责来确定工资标准。例如，如果合伙人担任店长，其工资应参照同行业同级别店长的市场水平。
- 结合业绩贡献：将合伙人的个人绩效与店铺整体目标挂钩，通过量化指标来决定薪酬的浮动。这可以激励合伙人更加积极地为店铺创造价值。
- 参考行业标准：通过薪酬调研确保工资水平具有竞争力，避免人才流失或成本虚高。可以查阅第三方机构发布的行业薪酬报告，或选取直接竞争对手进行薪资结构分析。
二、工资确定方式
合伙协议约定：
- 在合伙协议中明确工资发放的相关事宜，包括是否发放工资、工资标准、发放时间、发放方式等。这可以避免后续因工资问题产生的纠纷。
- 可以根据合伙人的出资比例、贡献程度、工作能力等因素确定工资系数，再结合店铺经营业绩计算具体数额。
合伙人协商确定：
- 如果合伙协议未明确约定工资标准，合伙人需要通过协商来确定。在协商过程中，应综合考虑各合伙人的实际情况、市场行情以及店铺的经营状况。
三、工资发放流程
制定工资表：
- 店铺财务人员根据合伙协议或协商确定的工资标准，结合合伙人的出勤、工作绩效等因素编制工资表。
- 工资表应详细列明合伙人姓名、工资标准、应发工资、扣除项目（如个人所得税）、实发工资等内容。
审核工资表：
- 工资表需经相关负责人审核，确保工资计算准确、扣除项目符合规定。
发放工资：
- 审核通过后，店铺按约定的方式（如银行转账、现金支付）向合伙人支付工资。
四、税务处理与劳动法规遵循
税务处理：
- 合伙人从店铺取得的工资收入需按“经营所得”项目缴纳个人所得税，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。
- 店铺应按时向税务机关报送纳税申报表并预缴税款，年度终了后办理汇算清缴。
劳动法规遵循：
- 尽管合伙企业有其特殊性，但在涉及合伙人作为员工的工资发放时，仍需遵守劳动法律法规。
- 工资不能低于当地最低工资标准，必须按时足额发放。
五、特殊情境下的处理方案
初创期店铺：
- 在初创期，店铺可能资金紧张，可以采用低基本工资+高期权或利润分成的组合方式。
- 例如，合伙人每月领取较低的生活费，同时获得店铺一定比例的期权或利润分成权。
成熟期店铺：
- 在成熟期，店铺可以推行全面薪酬福利体系，包括基本工资、绩效奖金、补充商业保险、带薪年假等附加权益。
合伙人角色转变：
- 如果合伙人从执行职务转变为顾问或其他非全职角色，需要重新协商薪酬方案。
- 可以改为按咨询服务费或其他方式支付报酬。
六、实际案例参考
以A、B、C三人成立的合伙店铺为例：
- 合伙协议约定A负责日常经营管理，每月工资1万元；B和C提供技术支持和市场资源，根据店铺盈利情况给予奖励。
- 店铺财务人员根据合伙协议编制工资表，经审核后通过银行转账支付A的工资，并为A代扣代缴个人所得税。
- 每季度或每年根据店铺盈利情况，按照约定比例向B和C发放奖励。
综上所述，合伙开店时股东（合伙人）的工资发放需要综合考虑岗位与职责、业绩贡献、行业标准、税务处理和劳动法规等多方面因素。在实际操作中，建议根据具体情况制定合适的工资发放方案，并确保方案的合法性和可行性。如遇法律或税务问题，应及时咨询专业律师或会计师。