针对您提出的“在职员工企业55岁38年工龄累计13年特殊工种档案一直在单位，但单位不给办退休”的问题，以下是我为您提供的详细解答步骤和建议：
一、了解原因并尝试沟通协商
主动询问：
- 首先，建议您与单位的人力资源部门或负责退休手续办理的相关人员进行深入沟通。明确表达您希望办理特殊工种退休的诉求，并询问单位不给办理的具体原因。
- 在沟通过程中，保持平和、理性的态度，有助于解决可能存在的误解或信息不对等问题。
查阅规定：
- 自行查阅国家和当地关于特殊工种退休的政策法规，确保自己确实符合退休条件。这包括年龄、工龄以及特殊工种的工作年限等要求。
- 若确认自己符合条件，则以平和的态度向单位说明情况，要求按规定办理退休手续。
二、收集整理证明材料
档案材料：
- 特殊工种退休主要依据职工档案认定。请确保您的档案中明确记录了特殊工种的工作经历，如工资表、调令、岗位津贴发放记录等。
- 若档案材料缺失，应尝试从原工作部门或车间查找原始资料进行补充。必要时，可请求单位协助查找或出具相关证明。
其他证明：
- 除档案外，您还可收集工作证、荣誉证书、同事证言等额外证据。同事证言需由曾一起从事特殊工种的同事出具，并签字按手印，同时留下联系方式以备核实。
三、向相关部门反映情况
单位上级主管部门：
- 若与单位沟通无果，可向单位的上级主管部门反映情况，请求介入调查并督促单位办理退休手续。
劳动监察部门：
- 劳动监察部门负责监督用人单位遵守劳动法规。您可向当地劳动监察部门投诉，并提交相关证明材料。监察部门将进行调查，并要求单位依法办理。
劳动仲裁委员会：
- 若劳动监察部门未能解决问题，您还可选择向劳动仲裁委员会提起仲裁申请。在申请前，需收集好证据并按规定填写申请书。仲裁委员会将依法进行裁决。
社会保险经办机构：
- 您可直接向当地社保经办机构咨询特殊工种退休事宜，并反映单位不给办理的情况。经办机构将根据档案和政策判断您是否符合退休条件，并指导您如何处理。
四、申请行政复议或提起行政诉讼
行政复议：
- 若经上述途径仍无法解决问题，且您认为社保经办机构在审核过程中存在不作为或错误认定，可在知道具体行政行为之日起六十日内向其上级主管部门或本级人民政府申请行政复议。
行政诉讼：
- 对行政复议决定不服的，您可在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起行政诉讼；也可直接在知道具体行政行为之日起六个月内向人民法院提起行政诉讼。提起诉讼需撰写起诉状并准备相关证据材料。
总结与建议：
面对单位不给办理特殊工种退休的情况，您应保持冷静并采取逐步升级的措施来维护自己的权益。从与单位沟通到寻求法律途径的帮助，每一步都需谨慎处理并确保诉求得到合理解决。在整个过程中，收集并整理好相关证据是至关重要的。同时，建议您咨询专业的法律人士或律师，以获取更具体、更专业的法律建议和支持。