结论：仅凭一次事故间隔四十秒后的二次碰撞就判定二次碰撞全责，这一判定是否合法不能一概而论，需要结合具体案情和证据来综合判断。

分析如下：

1. 事故责任划分的基本原则：

   • 在交通事故中，事故责任的划分通常依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，主要考虑各方当事人的行为对事故发生的作用以及过错的严重程度。
   • 责任划分需综合考量多种因素，包括但不限于当事人的驾驶行为、车辆状况、道路条件、交通信号等。

2. 二次碰撞的责任判定：

   • 二次碰撞的责任判定并非仅基于时间间隔（如四十秒），而是需要深入分析两次碰撞之间的因果关系、各方当事人的过错程度以及是否存在避让或减轻损害的可能性。
   • 如果二次碰撞是由于第一次碰撞后，某方当事人未采取合理措施（如未设置警示标志、未及时撤离现场等）导致，或者二次碰撞的直接原因是某方当事人的违法行为（如超速、酒驾等），则该方当事人可能承担主要或全部责任。
   • 反之，如果二次碰撞与第一次碰撞无直接因果关系，或者各方当事人均无过错，则可能根据实际情况划分责任或认定无责。

3. 合法性的判断：

   • 判定二次碰撞全责是否合法，关键在于是否遵循了事故责任划分的基本原则，是否充分考虑了所有相关证据和事实。
   • 如果交警部门或法院在判定责任时，未充分调查取证、未综合考虑各种因素，或者仅凭时间间隔就草率判定责任，那么这一判定可能缺乏合法性和合理性。

4. 建议：

   • 对于此类复杂交通事故，建议当事人及时收集并保存相关证据（如现场照片、视频、证人证言等），以便在责任划分时提供有力支持。
   • 如果对责任划分有异议，可以在规定时间内向交警部门提出复核申请，或者通过法律途径（如诉讼）来维护自己的合法权益。

举例说明：

• 假设第一次碰撞后，A车驾驶员未设置警示标志且未撤离现场，导致四十秒后B车因视线受阻发生二次碰撞。在此情况下，A车驾驶员可能因未履行安全义务而承担主要或全部责任。
• 反之，如果第一次碰撞后，双方均已采取合理措施且无违法行为，而二次碰撞是由于不可抗力（如突发自然灾害）导致，则可能根据实际情况划分责任或认定无责。

总结：交通事故的责任划分是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。对于二次碰撞的责任判定，更不能仅凭时间间隔就草率下结论。如果您对此类问题有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。