联合体协议书在投标时，资金分配比例是可以另行约定的。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律原则与合同自由：

   • 在法律框架内，合同双方（或多方）享有合同自由原则，即他们有权根据自己的意愿和协商结果来约定合同的内容，包括资金分配比例。联合体协议书作为合同的一种，同样适用这一原则。
   • 只要联合体协议书中的资金分配比例约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，且是各方真实意思的表示，那么该约定就是有效的。

2. 联合体协议书的特性：

   • 联合体协议书是联合体成员之间为了共同投标、承接项目而签订的协议。它明确了各成员的权利、义务和责任，包括资金投入、利润分配、风险承担等方面。
   • 在投标阶段，联合体成员可以根据项目的实际情况、各自的资金实力、技术能力等因素，协商确定资金分配比例。这种约定有助于确保项目的顺利进行和联合体成员之间的公平合作。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 明确约定：联合体协议书中应明确、具体地约定资金分配比例，避免模糊不清或产生歧义。
   • 合法合规：资金分配比例的约定应符合相关法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定。
   • 公平合理：资金分配比例应体现公平合理的原则，确保各成员根据其投入和贡献获得相应的回报。
   • 变更与调整：在项目实施过程中，如果因各种原因需要变更资金分配比例，联合体成员应协商一致，并签订书面变更协议。

4. 可能的法律后果：

   • 如果联合体协议书中的资金分配比例约定不明确或存在争议，可能导致联合体成员之间的纠纷和冲突，影响项目的顺利进行。
   • 如果资金分配比例的约定违反法律法规的强制性规定，该约定可能被认定为无效，联合体成员可能需要承担相应的法律责任。

建议：在签订联合体协议书时，各成员应充分协商、明确约定资金分配比例，并确保该约定合法合规、公平合理。如果在项目实施过程中需要变更资金分配比例，应及时协商一致并签订书面变更协议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。