结论前置：做防水开凿别人屋面是否违法及如何处理，需分情况讨论，具体如下：
- 未经同意开凿，涉嫌违法
若未经屋面所有权人或合法使用人同意，擅自开凿其屋面进行防水施工，可能涉及两方面违法：
- 民事侵权：根据《民法典》第238条，侵害物权造成权利人损害的，应承担赔偿责任。屋面属于业主专有部分或共有部分（依具体产权情况而定），未经许可破坏可能需赔偿修复费用、房屋贬值损失等。
- 行政违法：若开凿行为破坏房屋结构（如承重墙、梁等），可能违反《建设工程质量管理条例》第69条，涉及擅自变动房屋建筑主体结构，由住建部门责令改正，处5-10万元罚款；情节严重的，可能面临更高处罚。
处理建议：
- 立即停止施工，与权利人协商修复或赔偿；
- 若已造成损害，主动承担修复责任（如聘请专业机构恢复屋面原状）；
- 若涉及行政处罚，积极配合调查，争取从轻处理（如首次违法、未造成严重后果等）。
- 经同意开凿，但施工不当引发问题
若经权利人同意施工，但因施工方操作不规范（如未做防水层、破坏原有防水结构）导致屋面漏水或其他损害，可能涉及：
- 合同违约：若施工方与权利人签订了防水施工合同，未按约定标准施工，需承担违约责任（如返工、赔偿损失）；
- 侵权责任：若施工方过错导致第三方（如楼下邻居）财产受损，需根据《民法典》第1165条承担侵权赔偿责任。
处理建议：
- 保留施工合同、验收记录等证据，明确责任主体；
- 优先通过协商或调解解决（如联系物业、社区介入）；
- 若协商无果，可向法院起诉，要求施工方承担修复费用、赔偿损失等。
- 特殊情形：紧急避险或公共利益需要
若因紧急情况（如屋面漏水危及下方人员安全）需立即开凿维修，且无法及时联系权利人，可能适用《民法典》第182条“紧急避险”规则：
- 避险人（施工方）需在必要范围内采取措施，避免造成更大损害；
- 事后应及时通知权利人，并承担合理范围内的补偿责任（如修复费用）。
处理建议：
- 施工前尽量留存证据（如拍照、录像证明紧急情况）；
- 施工后主动与权利人沟通，说明情况并协商补偿方案。
总结：开凿他人屋面做防水的合法性取决于是否取得同意、施工是否规范及是否损害他人权益。若涉及违法或纠纷，建议优先通过协商、调解解决；若无法达成一致，可依法通过行政投诉或诉讼途径维权。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据和法律条款为您分析。