在原先违建上做防水是否违法，需分情况讨论，具体如下：
若违建本身未被相关部门认定并要求拆除，仅从防水工程本身来看：
- 防水工程本身并不直接构成违法，它是对建筑物进行维护和保养的一种常见措施。然而，由于该建筑物本身是违建，即未经规划、建设等部门批准擅自建设的，因此，在违建上进行任何形式的施工，包括防水工程，都可能面临被相关部门查处和要求整改的风险。
- 此外，如果防水工程涉及对建筑物结构的改动或加固，且未经过相关部门的审批和许可，那么这种行为还可能构成对建筑物结构的非法改动，进一步加重违法性质。
若违建已被相关部门认定并要求拆除：
- 在这种情况下，在违建上进行任何施工行为，包括防水工程，都是违法的。因为违建本身已经被认定为非法存在，且相关部门已经要求拆除，此时再进行施工不仅无法改变违建的性质，还可能阻碍拆除工作的进行，甚至可能面临更严厉的处罚。
法律后果与建议：
- 法律后果：对于在违建上进行施工的行为，相关部门有权进行查处，并可能要求停止施工、恢复原状、罚款等。如果情节严重，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
- 建议：
- 如果建筑物确实存在漏水等问题，且该建筑物尚未被认定为违建或虽被认定为违建但尚未被要求拆除，建议先向相关部门咨询并办理相关手续，确保施工行为的合法性。
- 如果建筑物已经被认定为违建且被要求拆除，那么应尽快停止任何施工行为，并积极配合相关部门的拆除工作。同时，也可以考虑通过合法途径申请重建或改建，以符合规划要求。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，未经批准擅自建设的建筑物属于违建，相关部门有权进行查处并要求拆除。
- 同时，根据《中华人民共和国建筑法》的相关规定，任何单位和个人进行建设活动，都必须遵守法律、法规和规章的规定，不得损害社会公共利益和他人的合法权益。
总之，在原先违建上做防水是否违法，需根据违建的具体情况和相关部门的认定来决定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。