在工业用地原有的房子楼顶进行违建，一般是不合法的。以下从几个关键角度为你详细分析：
土地使用性质不符：
- 工业用地是专为工业生产、研发等活动规划的，其使用性质与住宅或商业等用途存在本质区别。在工业用地上进行任何非工业用途的建设，包括在原有房屋楼顶进行违建，都可能违反土地用途管制制度。
- 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，土地使用者必须按照土地用途使用土地，未经批准不得擅自改变土地用途。因此，在工业用地楼顶违建，很可能因土地使用性质不符而被认定为违法。
未取得合法建设许可：
- 任何建设行为，包括在原有房屋楼顶进行加建或改建，都需要依法办理审批手续和建设许可。这些审批和许可通常基于土地符合建设规划等前提条件。
- 在工业用地上，由于土地性质的问题，往往无法获得针对非工业用途建设的合法规划许可、施工许可等必要证件。因此，缺乏这些许可而进行的违建行为，根据《中华人民共和国城乡规划法》和《中华人民共和国建筑法》的相关规定，将被视为违法建设。
特殊情况下的合法性探讨：
- 虽然一般情况下工业用地楼顶违建是不合法的，但也存在一些特殊情况。如果经过政府相关部门的批准，按照法定程序对工业用地进行了用途变更（例如变更为混合用途用地，且允许在楼顶进行一定形式的加建），并且满足了当地的规划、建筑规范等要求，那么在这种已经变性的土地上进行的加建行为可能不再属于违建。
- 然而，这种情况非常特殊且复杂，需要满足一系列严格的条件和程序。在实际操作中，这种情况较为罕见，且必须确保已经取得了所有必要的审批手续和建设许可。
法律后果与建议：
- 如果在工业用地楼顶进行违建，可能会面临被责令拆除、罚款等法律后果。此外，违建行为还可能影响房屋的产权登记、交易和抵押等，给业主带来不必要的麻烦和损失。
- 因此，我建议你避免在工业用地楼顶进行违建行为。如果你确实有加建或改建的需求，应该先咨询当地政府或相关部门，了解土地用途、建设规划等具体要求，并依法办理相关审批手续和建设许可。
总结与提醒：在工业用地原有的房子楼顶进行违建一般是不合法的，主要因为土地使用性质不符和未取得合法建设许可。如果你有任何关于房产或土地使用的法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业、全面的法律建议。